CoeSFMs: Coenzymes Binding Structural & Functional Motifs

Finding CoeSFMs for the coenzyme/vitamin 'TPP' ...

Ligand: ID

Full Name

Formula

Chemistry

TPP

THIAMINE DIPHOSPHATE

C12 H19 N4 O7 P2 S (1+)

TPP

There are 13 CoeSFMs:

Nbr of Motifs
per PDB entry

PDB Entry

Title

Determination Method

Resolution

R-Factor

3M34

Crystal structure of transketolase in complex with thiamin diphosphate and calcium ion

X-RAY

1.65

0.153

Motif No./Chain

Motif

Bound Ligand
/(Nbr. in PDB)

Show Details

1 / A

> Structure: HHLLLHHLSLLH +7w
> Sequence: AHGPLGDGENIIIH

TPP
/(7327)

[+]

> Graphics rep1:

[+]

> Graphics rep2:

[+]

Protein Chain	Prot SSE	Res Nbr	Res Name	RsAt.Name	LgAt.Name	Lg Chain	Lg Nbr	Bnd Len	Bnd Type
A	29-46 H: 1	31	ALA	CB	O3B	A	7327	3.44	van der Waals
A	65-67 H: 5	67	HIS	ND1	S1	A	7327	3.82
A	65-67 H: 5	67	HIS	CD2	O3B	A	7327	3.63	van der Waals
A	65-67 H: 5	67	HIS	CE1	S1	A	7327	3.87	van der Waals
A	65-67 H: 5	67	HIS	CE1	O3A	A	7327	3.69	van der Waals
A	65-67 H: 5	67	HIS	NE2	O3A	A	7327	3.35	H.Bond
A	65-67 H: 5	67	HIS	NE2	PB	A	7327	3.62
A	65-67 H: 5	67	HIS	NE2	O3B	A	7327	2.95	H.Bond
A	No SSE	114	GLY	O	N3*	A	7327	3.88	H.Bond
A	No SSE	114	GLY	O	C4*	A	7327	3.87	van der Waals
A	No SSE	114	GLY	O	N4*	A	7327	2.98	H.Bond
A	No SSE	115	PRO	CA	N3*	A	7327	3.72	H.Bond
A	No SSE	115	PRO	C	N3*	A	7327	3.82	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	N	C2*	A	7327	3.62	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	N	CM2	A	7327	3.54	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	N	N3*	A	7327	2.98	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	N	C4*	A	7327	3.91	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CA	N3*	A	7327	3.9	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	O	CM2	A	7327	3.96	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CB	C2*	A	7327	3.9	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CB	N3*	A	7327	3.59	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CG	N3*	A	7327	3.6	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CG	C4*	A	7327	3.65	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CG	N4*	A	7327	3.71	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CD1	N3*	A	7327	3.83	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CD1	C4*	A	7327	3.6	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CD1	N4*	A	7327	3.94	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CD1	C5*	A	7327	3.79	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CD1	N3	A	7327	3.65	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CD1	C2	A	7327	3.89	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CD1	S1	A	7327	3.78	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CD1	C5	A	7327	3.59	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CD1	C4	A	7327	3.47	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CD1	C7	A	7327	3.85	van der Waals
A	151-157 H: 1	151	GLY	CA	O2A	A	7327	3.94	van der Waals
A	151-157 H: 1	151	GLY	C	O2A	A	7327	3.82	van der Waals
A	151-157 H: 1	152	ASP	N	PA	A	7327	3.93
A	151-157 H: 1	152	ASP	N	O1A	A	7327	3.54	H.Bond
A	151-157 H: 1	152	ASP	N	O2A	A	7327	3.54	H.Bond
A	151-157 H: 1	152	ASP	CA	O1A	A	7327	3.86	van der Waals
A	151-157 H: 1	152	ASP	C	O2A	A	7327	3.96	van der Waals
A	151-157 H: 1	152	ASP	CB	O1A	A	7327	3.26	van der Waals
A	151-157 H: 1	152	ASP	CG	O1A	A	7327	3.82	van der Waals
A	151-157 H: 1	152	ASP	OD2	O1A	A	7327	3.43	H.Bond
A	151-157 H: 1	153	GLY	N	PA	A	7327	3.75
A	151-157 H: 1	153	GLY	N	O1A	A	7327	3.63	H.Bond
A	151-157 H: 1	153	GLY	N	O2A	A	7327	2.87	H.Bond
A	151-157 H: 1	153	GLY	CA	O2A	A	7327	3.45	van der Waals
A	157-170 H: 1	157	GLU	OE2	C2*	A	7327	3.9	van der Waals
A	157-170 H: 1	157	GLU	OE2	CM2	A	7327	3.18	van der Waals
A	No SSE	182	ASN	CG	O2B	A	7327	3.44	van der Waals
A	No SSE	182	ASN	OD1	O2B	A	7327	3.26	H.Bond
A	No SSE	182	ASN	ND2	O2B	A	7327	2.82	H.Bond
A	184-185 S: 0	184	ILE	O	O1A	A	7327	3.35	H.Bond
A	184-185 S: 0	184	ILE	O	O1B	A	7327	3.85	H.Bond
A	184-185 S: 0	184	ILE	O	O2B	A	7327	3.46	H.Bond
A	No SSE	186	ILE	CD1	C5	A	7327	3.9	van der Waals
A	No SSE	186	ILE	CD1	C4	A	7327	3.81	van der Waals
A	No SSE	186	ILE	CD1	CM4	A	7327	3.97	van der Waals
A	No SSE	242	ILE	CD1	O1B	A	7327	3.83	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	CG	O1B	A	7327	3.73	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	ND1	O3A	A	7327	3.86	H.Bond
A	252-256 H: 5	256	HIS	ND1	PB	A	7327	3.67
A	252-256 H: 5	256	HIS	ND1	O1B	A	7327	2.72	H.Bond
A	252-256 H: 5	256	HIS	ND1	O3B	A	7327	3.4	H.Bond
A	252-256 H: 5	256	HIS	CE1	S1	A	7327	3.38	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	CE1	O3A	A	7327	3.89	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	CE1	O1B	A	7327	3.5	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	CE1	O3B	A	7327	3.92	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	NE2	S1	A	7327	3.72
A	Water	634	HOH	O	PA	A	7327	3.78
A	Water	634	HOH	O	O1A	A	7327	3.45	H.Bond
A	Water	634	HOH	O	PB	A	7327	3.93
A	Water	634	HOH	O	O2B	A	7327	2.92	H.Bond
A	Water	692	HOH	O	N4*	A	7327	3.33	H.Bond
A	Water	692	HOH	O	C2	A	7327	3.36	van der Waals
A	Water	790	HOH	O	O3B	A	7327	2.78	H.Bond
A	Water	814	HOH	O	PA	A	7327	3.75
A	Water	814	HOH	O	O2A	A	7327	2.74	H.Bond
A	Water	837	HOH	O	N4*	A	7327	3.69	H.Bond
A	Water	889	HOH	O	PB	A	7327	3.5
A	Water	889	HOH	O	O2B	A	7327	3.3	H.Bond
A	Water	889	HOH	O	O3B	A	7327	3.69	H.Bond
A	Water	1051	HOH	O	C2	A	7327	3.56	van der Waals

Nbr of Motifs
per PDB entry

PDB Entry

Title

Determination Method

Resolution

R-Factor

3M6L

Crystal structure of transketolase in complex with thiamine diphosphate, ribose-5-phosphate and calcium ion

x-ray

1.59

0.162

Motif No./Chain

Motif

Bound Ligand
/(Nbr. in PDB)

Show Details

1 / A

> Structure: HHLLLSHHLSLLH +5w
> Sequence: AHGPLGDGENISIIH

TPP
/(5001)

[+]

> Graphics rep1:

[+]

> Graphics rep2:

[+]

Protein Chain	Prot SSE	Res Nbr	Res Name	RsAt.Name	LgAt.Name	Lg Chain	Lg Nbr	Bnd Len	Bnd Type
A	29-46 H: 1	31	ALA	CA	O1B	A	5001	3.95	van der Waals
A	29-46 H: 1	31	ALA	CB	O1B	A	5001	3.17	van der Waals
A	65-67 H: 5	67	HIS	ND1	O1B	A	5001	3.83	H.Bond
A	65-67 H: 5	67	HIS	CD2	S1	A	5001	3.86	van der Waals
A	65-67 H: 5	67	HIS	CE1	O3A	A	5001	3.4	van der Waals
A	65-67 H: 5	67	HIS	CE1	PB	A	5001	3.71
A	65-67 H: 5	67	HIS	CE1	O1B	A	5001	2.91	van der Waals
A	65-67 H: 5	67	HIS	NE2	S1	A	5001	3.91
A	65-67 H: 5	67	HIS	NE2	O3A	A	5001	3.62	H.Bond
A	65-67 H: 5	67	HIS	NE2	O1B	A	5001	3.83	H.Bond
A	No SSE	114	GLY	C	N4*	A	5001	3.96	H.Bond
A	No SSE	114	GLY	O	N3*	A	5001	3.81	H.Bond
A	No SSE	114	GLY	O	C4*	A	5001	3.78	van der Waals
A	No SSE	114	GLY	O	N4*	A	5001	2.83	H.Bond
A	No SSE	115	PRO	CA	N3*	A	5001	3.72	H.Bond
A	No SSE	115	PRO	C	N3*	A	5001	3.81	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	N	C2*	A	5001	3.66	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	N	CM2	A	5001	3.47	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	N	N3*	A	5001	2.98	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	N	C4*	A	5001	3.93	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CA	N3*	A	5001	3.9	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	O	CM2	A	5001	3.97	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CB	C2*	A	5001	3.99	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CB	N3*	A	5001	3.61	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CG	N3*	A	5001	3.55	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CG	C4*	A	5001	3.66	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CG	N4*	A	5001	3.69	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CD1	N3*	A	5001	3.73	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CD1	C4*	A	5001	3.59	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CD1	N4*	A	5001	3.92	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CD1	C5*	A	5001	3.83	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CD1	N3	A	5001	3.71	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CD1	C2	A	5001	3.83	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CD1	S1	A	5001	3.84	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CD1	C5	A	5001	3.57	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CD1	C4	A	5001	3.52	van der Waals
A	146-151 S: 1	151	GLY	CA	O1A	A	5001	3.65	van der Waals
A	146-151 S: 1	151	GLY	C	O1A	A	5001	3.6	van der Waals
A	152-157 H: 1	152	ASP	N	PA	A	5001	3.99
A	152-157 H: 1	152	ASP	N	O1A	A	5001	3.33	H.Bond
A	152-157 H: 1	152	ASP	N	O2A	A	5001	3.62	H.Bond
A	152-157 H: 1	152	ASP	CA	O2A	A	5001	3.89	van der Waals
A	152-157 H: 1	152	ASP	C	O1A	A	5001	3.88	van der Waals
A	152-157 H: 1	152	ASP	CB	O2A	A	5001	3.23	van der Waals
A	152-157 H: 1	152	ASP	CG	O2A	A	5001	3.79	van der Waals
A	152-157 H: 1	152	ASP	OD2	O2A	A	5001	3.44	H.Bond
A	152-157 H: 1	153	GLY	N	O7	A	5001	3.89	H.Bond
A	152-157 H: 1	153	GLY	N	PA	A	5001	3.68
A	152-157 H: 1	153	GLY	N	O1A	A	5001	2.88	H.Bond
A	152-157 H: 1	153	GLY	N	O2A	A	5001	3.72	H.Bond
A	152-157 H: 1	153	GLY	CA	O1A	A	5001	3.48	van der Waals
A	157-170 H: 1	157	GLU	OE2	N1*	A	5001	3.94	H.Bond
A	157-170 H: 1	157	GLU	OE2	C2*	A	5001	3.97	van der Waals
A	157-170 H: 1	157	GLU	OE2	CM2	A	5001	3.28	van der Waals
A	No SSE	182	ASN	CG	O2B	A	5001	3.49	van der Waals
A	No SSE	182	ASN	OD1	O2B	A	5001	3.32	H.Bond
A	No SSE	182	ASN	ND2	O2B	A	5001	2.81	H.Bond
A	184-185 S: 0	184	ILE	O	O2A	A	5001	3.33	H.Bond
A	184-185 S: 0	184	ILE	O	O2B	A	5001	3.48	H.Bond
A	184-185 S: 0	185	SER	CB	C7	A	5001	3.97	van der Waals
A	No SSE	186	ILE	CD1	C5	A	5001	3.87	van der Waals
A	No SSE	186	ILE	CD1	C4	A	5001	3.67	van der Waals
A	No SSE	186	ILE	CD1	CM4	A	5001	3.94	van der Waals
A	No SSE	242	ILE	CD1	O2B	A	5001	3.89	van der Waals
A	No SSE	242	ILE	CD1	O3B	A	5001	3.61	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	CB	O3B	A	5001	3.8	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	CG	O3B	A	5001	3.49	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	ND1	PB	A	5001	3.68
A	252-256 H: 5	256	HIS	ND1	O3B	A	5001	2.48	H.Bond
A	252-256 H: 5	256	HIS	CE1	S1	A	5001	3.32	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	CE1	C7	A	5001	3.86	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	CE1	O3B	A	5001	3.33	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	NE2	S1	A	5001	3.68
A	Water	756	HOH	O	PA	A	5001	3.76
A	Water	756	HOH	O	O1A	A	5001	2.67	H.Bond
A	Water	756	HOH	O	O3A	A	5001	3.89	H.Bond
A	Water	782	HOH	O	O1B	A	5001	3.31	H.Bond
A	Water	782	HOH	O	O3B	A	5001	3.72	H.Bond
A	Water	794	HOH	O	PA	A	5001	3.86
A	Water	794	HOH	O	O2A	A	5001	3.32	H.Bond
A	Water	794	HOH	O	O2B	A	5001	3.15	H.Bond
A	Water	857	HOH	O	N4*	A	5001	3.87	H.Bond
A	Water	1086	HOH	O	O3A	A	5001	3.78	H.Bond
A	Water	1086	HOH	O	PB	A	5001	3.52
A	Water	1086	HOH	O	O1B	A	5001	2.95	H.Bond
A	Water	1086	HOH	O	O2B	A	5001	3.46	H.Bond

Nbr of Motifs
per PDB entry

PDB Entry

Title

Determination Method

Resolution

R-Factor

3M7I

Crystal structure of transketolase in complex with thiamine diphosphate, ribose-5-phosphate(pyranose form) and magnesium ion

x-ray

1.75

0.171

Motif No./Chain

Motif

Bound Ligand
/(Nbr. in PDB)

Show Details

1 / A

> Structure: HHLLLHHLSLLH +5w
> Sequence: AHGPLGDGENISIIH

TPP
/(5001)

[+]

> Graphics rep1:

[+]

> Graphics rep2:

[+]

Protein Chain	Prot SSE	Res Nbr	Res Name	RsAt.Name	LgAt.Name	Lg Chain	Lg Nbr	Bnd Len	Bnd Type
A	29-46 H: 1	31	ALA	CB	O1B	A	5001	3.55	van der Waals
A	65-67 H: 5	67	HIS	ND1	S1	A	5001	3.8
A	65-67 H: 5	67	HIS	CD2	O1B	A	5001	3.64	van der Waals
A	65-67 H: 5	67	HIS	CE1	S1	A	5001	3.98	van der Waals
A	65-67 H: 5	67	HIS	CE1	O3A	A	5001	3.68	van der Waals
A	65-67 H: 5	67	HIS	NE2	O3A	A	5001	3.32	H.Bond
A	65-67 H: 5	67	HIS	NE2	PB	A	5001	3.83
A	65-67 H: 5	67	HIS	NE2	O1B	A	5001	2.93	H.Bond
A	No SSE	114	GLY	O	N3*	A	5001	3.82	H.Bond
A	No SSE	114	GLY	O	C4*	A	5001	3.83	van der Waals
A	No SSE	114	GLY	O	N4*	A	5001	2.9	H.Bond
A	No SSE	115	PRO	CA	N3*	A	5001	3.84	H.Bond
A	No SSE	115	PRO	C	N3*	A	5001	3.9	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	N	C2*	A	5001	3.63	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	N	CM2	A	5001	3.43	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	N	N3*	A	5001	3.04	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	N	C4*	A	5001	3.97	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CA	N3*	A	5001	3.92	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	O	CM2	A	5001	3.78	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CB	C2*	A	5001	3.89	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CB	N3*	A	5001	3.61	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CG	N3*	A	5001	3.54	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CG	C4*	A	5001	3.66	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CG	N4*	A	5001	3.71	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CD1	C2*	A	5001	3.97	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CD1	N3*	A	5001	3.61	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CD1	C4*	A	5001	3.49	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CD1	N4*	A	5001	3.85	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CD1	C5*	A	5001	3.72	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CD1	N3	A	5001	3.84	H.Bond
A	No SSE	116	LEU	CD1	C5	A	5001	3.64	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CD1	C4	A	5001	3.48	van der Waals
A	No SSE	116	LEU	CD1	CM4	A	5001	3.84	van der Waals
A	151-157 H: 1	151	GLY	CA	O1A	A	5001	3.76	van der Waals
A	151-157 H: 1	151	GLY	C	O1A	A	5001	3.71	van der Waals
A	151-157 H: 1	152	ASP	N	O1A	A	5001	3.42	H.Bond
A	151-157 H: 1	152	ASP	N	O2A	A	5001	3.52	H.Bond
A	151-157 H: 1	152	ASP	CA	O2A	A	5001	3.8	van der Waals
A	151-157 H: 1	152	ASP	C	O1A	A	5001	3.97	van der Waals
A	151-157 H: 1	152	ASP	CB	O2A	A	5001	3.15	van der Waals
A	151-157 H: 1	152	ASP	CG	O2A	A	5001	3.62	van der Waals
A	151-157 H: 1	152	ASP	OD2	O2A	A	5001	3.22	H.Bond
A	151-157 H: 1	153	GLY	N	PA	A	5001	3.71
A	151-157 H: 1	153	GLY	N	O1A	A	5001	2.92	H.Bond
A	151-157 H: 1	153	GLY	N	O2A	A	5001	3.74	H.Bond
A	151-157 H: 1	153	GLY	CA	O1A	A	5001	3.58	van der Waals
A	157-170 H: 1	157	GLU	OE2	C2*	A	5001	3.9	van der Waals
A	157-170 H: 1	157	GLU	OE2	CM2	A	5001	3.16	van der Waals
A	No SSE	182	ASN	CG	O2B	A	5001	3.37	van der Waals
A	No SSE	182	ASN	OD1	O2B	A	5001	3.2	H.Bond
A	No SSE	182	ASN	ND2	O2B	A	5001	2.76	H.Bond
A	184-185 S: 0	184	ILE	C	O3B	A	5001	3.91	van der Waals
A	184-185 S: 0	184	ILE	O	O2A	A	5001	2.98	H.Bond
A	184-185 S: 0	184	ILE	O	PB	A	5001	3.82
A	184-185 S: 0	184	ILE	O	O2B	A	5001	3.33	H.Bond
A	184-185 S: 0	184	ILE	O	O3B	A	5001	3.23	H.Bond
A	184-185 S: 0	185	SER	CA	O7	A	5001	3.91	van der Waals
A	184-185 S: 0	185	SER	CA	O3B	A	5001	3.85	van der Waals
A	184-185 S: 0	185	SER	CB	O7	A	5001	3.76	van der Waals
A	No SSE	186	ILE	CD1	C5	A	5001	3.78	van der Waals
A	No SSE	186	ILE	CD1	C4	A	5001	3.69	van der Waals
A	No SSE	186	ILE	CD1	CM4	A	5001	3.98	van der Waals
A	No SSE	242	ILE	CD1	O3B	A	5001	3.96	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	CG	O3B	A	5001	3.91	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	ND1	C7	A	5001	3.97	H.Bond
A	252-256 H: 5	256	HIS	ND1	PB	A	5001	3.67
A	252-256 H: 5	256	HIS	ND1	O1B	A	5001	3.19	H.Bond
A	252-256 H: 5	256	HIS	ND1	O3B	A	5001	3.05	H.Bond
A	252-256 H: 5	256	HIS	CE1	S1	A	5001	3.25	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	CE1	C5	A	5001	3.99	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	CE1	C7	A	5001	3.5	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	CE1	O1B	A	5001	3.78	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	CE1	O3B	A	5001	3.88	van der Waals
A	252-256 H: 5	256	HIS	NE2	S1	A	5001	3.5
A	Water	728	HOH	O	N4*	A	5001	3.91	H.Bond
A	Water	787	HOH	O	PA	A	5001	3.76
A	Water	787	HOH	O	O1A	A	5001	3.97	H.Bond
A	Water	787	HOH	O	O2A	A	5001	3.1	H.Bond
A	Water	787	HOH	O	O3A	A	5001	3.94	H.Bond
A	Water	787	HOH	O	PB	A	5001	3.93
A	Water	787	HOH	O	O2B	A	5001	2.68	H.Bond
A	Water	829	HOH	O	O1B	A	5001	2.78	H.Bond
A	Water	855	HOH	O	PA	A	5001	3.98
A	Water	855	HOH	O	O1A	A	5001	2.73	H.Bond
A	Water	855	HOH	O	O3A	A	5001	3.98	H.Bond
A	Water	881	HOH	O	O3A	A	5001	3.88	H.Bond
A	Water	881	HOH	O	PB	A	5001	3.71
A	Water	881	HOH	O	O1B	A	5001	3.85	H.Bond
A	Water	881	HOH	O	O2B	A	5001	2.99	H.Bond

Nbr of Motifs
per PDB entry

PDB Entry

Title

Determination Method

Resolution

R-Factor

3EKI

Structural insights of the Mycoplasma hyorhinis protein Mh-p37: A putative thiamine pyrophosphate transporter

x-ray

1.60

0.183

Motif No./Chain

Motif

Bound Ligand
/(Nbr. in PDB)

Show Details

1 / A

> Structure: HLLLLLLLSHLLH +11w
> Sequence: AKNVYSSSKEWYDPLLG

TPP
/(551)

[+]

> Graphics rep1:

[+]

> Graphics rep2:

[+]

Protein Chain	Prot SSE	Res Nbr	Res Name	RsAt.Name	LgAt.Name	Lg Chain	Lg Nbr	Bnd Len	Bnd Type
A	126-137 H: 1	126	ALA	CB	O3A	A	551	3.66	van der Waals
A	126-137 H: 1	129	LYS	CD	O2B	A	551	3.9	van der Waals
A	126-137 H: 1	129	LYS	CE	O2B	A	551	3.57	van der Waals
A	126-137 H: 1	129	LYS	NZ	O3A	A	551	3.55	H.Bond
A	126-137 H: 1	129	LYS	NZ	PB	A	551	3.58
A	126-137 H: 1	129	LYS	NZ	O2B	A	551	2.99	H.Bond
A	126-137 H: 1	129	LYS	NZ	O3B	A	551	3.45	H.Bond
A	No SSE	200	ASN	CG	CM2	A	551	3.64	van der Waals
A	No SSE	200	ASN	OD1	CM2	A	551	3.24	van der Waals
A	No SSE	200	ASN	ND2	CM2	A	551	3.5	H.Bond
A	No SSE	201	VAL	CG1	CM2	A	551	3.45	van der Waals
A	No SSE	215	TYR	CD2	CM4	A	551	3.71	van der Waals
A	No SSE	215	TYR	CD2	C6	A	551	3.95	van der Waals
A	No SSE	215	TYR	CE1	C6	A	551	3.76	van der Waals
A	No SSE	215	TYR	CE2	CM4	A	551	3.89	van der Waals
A	No SSE	215	TYR	CE2	C6	A	551	3.63	van der Waals
A	No SSE	215	TYR	CE2	C7	A	551	3.92	van der Waals
A	No SSE	215	TYR	CE2	O7	A	551	3.75	van der Waals
A	No SSE	215	TYR	CE2	O1B	A	551	3.81	van der Waals
A	No SSE	215	TYR	CZ	C6	A	551	3.52	van der Waals
A	No SSE	215	TYR	CZ	C7	A	551	3.56	van der Waals
A	No SSE	215	TYR	CZ	O7	A	551	3.76	van der Waals
A	No SSE	215	TYR	CZ	O1B	A	551	3.65	van der Waals
A	No SSE	215	TYR	OH	C6	A	551	3.94	van der Waals
A	No SSE	215	TYR	OH	C7	A	551	3.42	van der Waals
A	No SSE	215	TYR	OH	O7	A	551	3.47	H.Bond
A	No SSE	215	TYR	OH	O3A	A	551	3.84	H.Bond
A	No SSE	215	TYR	OH	PB	A	551	3.69
A	No SSE	215	TYR	OH	O1B	A	551	2.62	H.Bond
A	No SSE	255	SER	CA	O2B	A	551	3.62	van der Waals
A	No SSE	255	SER	CA	O3B	A	551	3.79	van der Waals
A	No SSE	255	SER	C	O2B	A	551	3.69	van der Waals
A	No SSE	255	SER	CB	O3B	A	551	3.38	van der Waals
A	No SSE	255	SER	OG	PB	A	551	3.49
A	No SSE	255	SER	OG	O1B	A	551	3.83	H.Bond
A	No SSE	255	SER	OG	O2B	A	551	3.77	H.Bond
A	No SSE	255	SER	OG	O3B	A	551	2.49	H.Bond
A	No SSE	256	SER	N	PB	A	551	3.67
A	No SSE	256	SER	N	O1B	A	551	3.68	H.Bond
A	No SSE	256	SER	N	O2B	A	551	2.89	H.Bond
A	No SSE	256	SER	CA	O1B	A	551	3.96	van der Waals
A	No SSE	256	SER	CA	O2B	A	551	3.87	van der Waals
A	No SSE	256	SER	C	O1B	A	551	3.86	van der Waals
A	No SSE	256	SER	CB	O1B	A	551	3.8	van der Waals
A	No SSE	256	SER	CB	O2B	A	551	3.83	van der Waals
A	No SSE	256	SER	OG	O2B	A	551	3.82	H.Bond
A	No SSE	257	SER	N	PB	A	551	3.89
A	No SSE	257	SER	N	O1B	A	551	2.89	H.Bond
A	No SSE	257	SER	CA	O1B	A	551	3.6	van der Waals
A	No SSE	257	SER	CB	O1B	A	551	3.23	van der Waals
A	No SSE	257	SER	OG	PB	A	551	3.72
A	No SSE	257	SER	OG	O1B	A	551	2.65	H.Bond
A	No SSE	257	SER	OG	O3B	A	551	3.81	H.Bond
A	No SSE	258	LYS	CE	O1A	A	551	3.83	van der Waals
A	No SSE	258	LYS	CE	O3B	A	551	3.08	van der Waals
A	No SSE	258	LYS	NZ	O1A	A	551	2.68	H.Bond
A	No SSE	258	LYS	NZ	O3B	A	551	3.04	H.Bond
A	304-308 S: 1	308	GLU	CG	CM4	A	551	3.87	van der Waals
A	304-308 S: 1	308	GLU	OE1	O1A	A	551	3.93	H.Bond
A	310-315 H: 5	314	TRP	CB	C2*	A	551	3.96	van der Waals
A	310-315 H: 5	314	TRP	CG	N3*	A	551	3.99	H.Bond
A	310-315 H: 5	314	TRP	CD2	N1*	A	551	3.87	H.Bond
A	310-315 H: 5	314	TRP	CD2	C5*	A	551	3.68	van der Waals
A	310-315 H: 5	314	TRP	CD2	C6*	A	551	3.56	van der Waals
A	310-315 H: 5	314	TRP	CE2	C5*	A	551	3.67	van der Waals
A	310-315 H: 5	314	TRP	CE2	C6*	A	551	3.99	van der Waals
A	310-315 H: 5	314	TRP	CE2	C7*	A	551	3.71	van der Waals
A	310-315 H: 5	314	TRP	CE3	N1*	A	551	3.62	H.Bond
A	310-315 H: 5	314	TRP	CE3	C5*	A	551	3.89	van der Waals
A	310-315 H: 5	314	TRP	CE3	C6*	A	551	3.31	van der Waals
A	310-315 H: 5	314	TRP	CZ2	C5*	A	551	3.89	van der Waals
A	310-315 H: 5	314	TRP	CZ2	C7*	A	551	3.41	van der Waals
A	310-315 H: 5	314	TRP	CZ3	C6*	A	551	3.53	van der Waals
A	310-315 H: 5	314	TRP	CH2	C6*	A	551	3.97	van der Waals
A	310-315 H: 5	314	TRP	CH2	C7*	A	551	3.61	van der Waals
A	No SSE	343	TYR	CE1	S1	A	551	3.8	van der Waals
A	No SSE	343	TYR	CE2	C5	A	551	3.86	van der Waals
A	No SSE	343	TYR	CE2	C6	A	551	3.96	van der Waals
A	No SSE	343	TYR	CZ	S1	A	551	3.82	van der Waals
A	No SSE	343	TYR	CZ	C5	A	551	3.63	van der Waals
A	No SSE	343	TYR	CZ	C4	A	551	3.93	van der Waals
A	No SSE	343	TYR	OH	C5*	A	551	3.91	van der Waals
A	No SSE	343	TYR	OH	C6*	A	551	3.41	van der Waals
A	No SSE	343	TYR	OH	C7*	A	551	3.78	van der Waals
A	No SSE	343	TYR	OH	N3	A	551	3.25	H.Bond
A	No SSE	343	TYR	OH	C2	A	551	3.46	van der Waals
A	No SSE	343	TYR	OH	S1	A	551	3.8
A	No SSE	343	TYR	OH	C5	A	551	3.64	van der Waals
A	No SSE	343	TYR	OH	C4	A	551	3.47	van der Waals
A	No SSE	343	TYR	OH	CM4	A	551	3.96	van der Waals
A	No SSE	344	ASP	CG	S1	A	551	3.76	van der Waals
A	No SSE	344	ASP	OD1	S1	A	551	3.63
A	No SSE	344	ASP	OD1	C5	A	551	3.86	van der Waals
A	No SSE	344	ASP	OD1	C6	A	551	3.23	van der Waals
A	No SSE	344	ASP	OD1	C7	A	551	3.11	van der Waals
A	No SSE	344	ASP	OD2	S1	A	551	3.5
A	375-380 H: 5	377	PRO	O	CM2	A	551	3.84	van der Waals
A	375-380 H: 5	378	LEU	O	CM2	A	551	3.79	van der Waals
A	375-380 H: 5	378	LEU	O	N3*	A	551	3.79	H.Bond
A	375-380 H: 5	379	LEU	C	C2*	A	551	3.84	van der Waals
A	375-380 H: 5	379	LEU	C	N3*	A	551	3.86	H.Bond
A	375-380 H: 5	379	LEU	O	N3*	A	551	3.93	H.Bond
A	375-380 H: 5	379	LEU	O	C4*	A	551	3.72	van der Waals
A	375-380 H: 5	379	LEU	O	C5*	A	551	3.8	van der Waals
A	375-380 H: 5	379	LEU	O	C6*	A	551	3.97	van der Waals
A	375-380 H: 5	379	LEU	O	C2	A	551	3.01	van der Waals
A	375-380 H: 5	379	LEU	O	S1	A	551	3.83
A	375-380 H: 5	380	GLY	N	N1*	A	551	3.92	H.Bond
A	375-380 H: 5	380	GLY	N	C2*	A	551	3.75	H.Bond
A	375-380 H: 5	380	GLY	N	CM2	A	551	3.85	H.Bond
A	375-380 H: 5	380	GLY	CA	N1*	A	551	3.64	H.Bond
A	375-380 H: 5	380	GLY	CA	C2*	A	551	3.96	van der Waals
A	Water	1002	HOH	O	C6	A	551	3.82	van der Waals
A	Water	1002	HOH	O	C7	A	551	3.61	van der Waals
A	Water	1024	HOH	O	PB	A	551	3.77
A	Water	1024	HOH	O	O2B	A	551	2.6	H.Bond
A	Water	1026	HOH	O	N1*	A	551	2.72	H.Bond
A	Water	1026	HOH	O	C2*	A	551	3.79	van der Waals
A	Water	1026	HOH	O	C6*	A	551	3.32	van der Waals
A	Water	1033	HOH	O	C6*	A	551	3.75	van der Waals
A	Water	1033	HOH	O	CM4	A	551	3.64	van der Waals
A	Water	1047	HOH	O	S1	A	551	3.81
A	Water	1047	HOH	O	C7	A	551	3.99	van der Waals
A	Water	1047	HOH	O	O2A	A	551	2.86	H.Bond
A	Water	1061	HOH	O	C7*	A	551	3.5	van der Waals
A	Water	1061	HOH	O	N3	A	551	3.59	H.Bond
A	Water	1061	HOH	O	C4	A	551	3.45	van der Waals
A	Water	1061	HOH	O	CM4	A	551	3.52	van der Waals
A	Water	1061	HOH	O	O7	A	551	3.86	H.Bond
A	Water	1061	HOH	O	PA	A	551	3.79
A	Water	1061	HOH	O	O1A	A	551	2.85	H.Bond
A	Water	1072	HOH	O	PA	A	551	3.84
A	Water	1072	HOH	O	O2A	A	551	2.92	H.Bond
A	Water	1072	HOH	O	O3A	A	551	3.45	H.Bond
A	Water	1106	HOH	O	O1A	A	551	3.7	H.Bond
A	Water	1106	HOH	O	O3A	A	551	3.85	H.Bond
A	Water	1106	HOH	O	PB	A	551	3.76
A	Water	1106	HOH	O	O3B	A	551	2.58	H.Bond
A	Water	1124	HOH	O	C4*	A	551	3.99	van der Waals
A	Water	1124	HOH	O	N4*	A	551	2.92	H.Bond
A	Water	1124	HOH	O	C7*	A	551	3.61	van der Waals
A	Water	1124	HOH	O	N3	A	551	3.64	H.Bond
A	Water	1124	HOH	O	C2	A	551	3.68	van der Waals
A	Water	1176	HOH	O	N4*	A	551	3.51	H.Bond
A	Water	1264	HOH	O	N3*	A	551	3.12	H.Bond
A	Water	1264	HOH	O	C4*	A	551	3.79	van der Waals
A	Water	1264	HOH	O	N4*	A	551	3.61	H.Bond

Nbr of Motifs
per PDB entry

PDB Entry

Title

Determination Method

Resolution

R-Factor

3HWX

Crystal structure of menaquinone synthesis protein MenD from E. coli in complex with ThDP

X-RAY

2.60

0.199

Motif No./Chain

Motif

Bound Ligand
/(Nbr. in PDB)

Show Details

1 / A

> Structure: HLLLLSHLLLH +3w
> Sequence: SLSGIDGDLSYNGGQIF

TPP
/(601)

[+]

> Graphics rep1:

[+]

> Graphics rep2:

[+]

Protein Chain	Prot SSE	Res Nbr	Res Name	RsAt.Name	LgAt.Name	Lg Chain	Lg Nbr	Bnd Len	Bnd Type
A	391-401 H: 1	391	SER	CB	S1	A	601	3.67	van der Waals
A	391-401 H: 1	391	SER	CB	O3A	A	601	3.44	van der Waals
A	391-401 H: 1	391	SER	CB	PB	A	601	3.75
A	391-401 H: 1	391	SER	CB	O1B	A	601	3.43	van der Waals
A	391-401 H: 1	391	SER	CB	O2B	A	601	3.58	van der Waals
A	391-401 H: 1	391	SER	OG	S1	A	601	3.38
A	391-401 H: 1	391	SER	OG	C6	A	601	3.6	van der Waals
A	391-401 H: 1	391	SER	OG	C7	A	601	3.78	van der Waals
A	391-401 H: 1	391	SER	OG	O3A	A	601	3.34	H.Bond
A	391-401 H: 1	391	SER	OG	PB	A	601	3.16
A	391-401 H: 1	391	SER	OG	O1B	A	601	3.05	H.Bond
A	391-401 H: 1	391	SER	OG	O2B	A	601	2.51	H.Bond
A	391-401 H: 1	392	LEU	N	O1B	A	601	3.03	H.Bond
A	391-401 H: 1	392	LEU	CA	O1B	A	601	3.57	van der Waals
A	391-401 H: 1	392	LEU	CB	O1B	A	601	3.05	van der Waals
A	391-401 H: 1	392	LEU	CG	O1B	A	601	3.36	van der Waals
A	391-401 H: 1	392	LEU	CD1	O1B	A	601	3.86	van der Waals
A	No SSE	416	SER	O	N4*	A	601	3.3	H.Bond
A	No SSE	417	GLY	CA	N3*	A	601	3.68	H.Bond
A	No SSE	418	ILE	N	N3*	A	601	3.47	H.Bond
A	No SSE	418	ILE	CG1	N1*	A	601	3.8	H.Bond
A	No SSE	418	ILE	CG1	C2*	A	601	3.76	van der Waals
A	No SSE	418	ILE	CG1	N3*	A	601	3.81	H.Bond
A	No SSE	418	ILE	CG1	C4*	A	601	3.9	van der Waals
A	No SSE	418	ILE	CG1	C5*	A	601	3.95	van der Waals
A	No SSE	418	ILE	CG1	C6*	A	601	3.92	van der Waals
A	No SSE	418	ILE	CG2	C7	A	601	3.96	van der Waals
A	No SSE	418	ILE	CD1	CM4	A	601	3.68	van der Waals
A	No SSE	419	ASP	CB	CM2	A	601	3.75	van der Waals
A	No SSE	419	ASP	CG	CM2	A	601	3.78	van der Waals
A	No SSE	419	ASP	OD1	CM2	A	601	3.38	van der Waals
A	436-441 S: 1	441	GLY	CA	PA	A	601	3.83
A	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O1A	A	601	3.4	van der Waals
A	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O2A	A	601	3.7	van der Waals
A	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O3A	A	601	3.86	van der Waals
A	436-441 S: 1	441	GLY	C	PA	A	601	3.97
A	436-441 S: 1	441	GLY	C	O1A	A	601	3.26	van der Waals
A	436-441 S: 1	441	GLY	C	O2A	A	601	3.65	van der Waals
A	436-441 S: 1	441	GLY	O	O1A	A	601	3.56	H.Bond
A	442-448 H: 1	442	ASP	N	PA	A	601	3.95
A	442-448 H: 1	442	ASP	N	O1A	A	601	3.59	H.Bond
A	442-448 H: 1	442	ASP	N	O2A	A	601	3.15	H.Bond
A	442-448 H: 1	442	ASP	CA	O2A	A	601	3.97	van der Waals
A	442-448 H: 1	442	ASP	C	O1A	A	601	3.98	van der Waals
A	442-448 H: 1	442	ASP	CG	O2A	A	601	3.68	van der Waals
A	442-448 H: 1	442	ASP	OD1	O2A	A	601	3.46	H.Bond
A	442-448 H: 1	442	ASP	OD2	O2A	A	601	3.94	H.Bond
A	442-448 H: 1	443	LEU	N	PA	A	601	3.71
A	442-448 H: 1	443	LEU	N	O1A	A	601	3.15	H.Bond
A	442-448 H: 1	443	LEU	N	O2A	A	601	3.31	H.Bond
A	442-448 H: 1	443	LEU	CA	O1A	A	601	3.55	van der Waals
A	442-448 H: 1	443	LEU	C	O1A	A	601	3.52	van der Waals
A	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O7	A	601	3.53	van der Waals
A	442-448 H: 1	443	LEU	CB	PA	A	601	3.86
A	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O1A	A	601	3.56	van der Waals
A	442-448 H: 1	443	LEU	CG	O7	A	601	3.75	van der Waals
A	442-448 H: 1	443	LEU	CD1	O7	A	601	3.62	van der Waals
A	442-448 H: 1	444	SER	N	O1A	A	601	2.74	H.Bond
A	442-448 H: 1	444	SER	CA	O1A	A	601	3.69	van der Waals
A	442-448 H: 1	444	SER	CB	O1A	A	601	3.62	van der Waals
A	442-448 H: 1	444	SER	OG	PA	A	601	3.96
A	442-448 H: 1	444	SER	OG	O1A	A	601	2.65	H.Bond
A	442-448 H: 1	447	TYR	CE2	CM2	A	601	3.96	van der Waals
A	442-448 H: 1	447	TYR	OH	CM2	A	601	3.78	van der Waals
A	No SSE	469	ASN	CG	O3B	A	601	3.41	van der Waals
A	No SSE	469	ASN	OD1	O2A	A	601	3.76	H.Bond
A	No SSE	469	ASN	OD1	O3B	A	601	2.96	H.Bond
A	No SSE	469	ASN	ND2	O3B	A	601	3.11	H.Bond
A	No SSE	471	GLY	C	O2A	A	601	3.84	van der Waals
A	No SSE	471	GLY	O	O2A	A	601	3.07	H.Bond
A	No SSE	471	GLY	O	O3B	A	601	3.14	H.Bond
A	No SSE	472	GLY	CA	C6	A	601	3.81	van der Waals
A	No SSE	472	GLY	CA	O7	A	601	3.32	van der Waals
A	No SSE	472	GLY	CA	O2B	A	601	3.38	van der Waals
A	No SSE	472	GLY	C	O2B	A	601	3.45	van der Waals
A	473-478 H: 1	473	GLN	N	PB	A	601	3.84
A	473-478 H: 1	473	GLN	N	O2B	A	601	3.16	H.Bond
A	473-478 H: 1	473	GLN	N	O3B	A	601	3.35	H.Bond
A	473-478 H: 1	474	ILE	N	O2B	A	601	3.26	H.Bond
A	473-478 H: 1	474	ILE	CB	O2B	A	601	3.92	van der Waals
A	473-478 H: 1	475	PHE	CE2	C5	A	601	3.94	van der Waals
A	473-478 H: 1	475	PHE	CE2	C4	A	601	3.81	van der Waals
A	473-478 H: 1	475	PHE	CE2	CM4	A	601	3.94	van der Waals
A	Water	659	HOH	O	O3A	A	601	3.37	H.Bond
A	Water	659	HOH	O	PB	A	601	3.72
A	Water	659	HOH	O	O1B	A	601	2.89	H.Bond
A	Water	702	HOH	O	PA	A	601	3.71
A	Water	702	HOH	O	O2A	A	601	2.74	H.Bond
A	Water	702	HOH	O	O3A	A	601	3.57	H.Bond
A	Water	702	HOH	O	PB	A	601	3.45
A	Water	702	HOH	O	O1B	A	601	3.98	H.Bond
A	Water	702	HOH	O	O3B	A	601	2.54	H.Bond
A	Water	771	HOH	O	O3A	A	601	3.87	H.Bond
A	Water	771	HOH	O	PB	A	601	3.14
A	Water	771	HOH	O	O1B	A	601	2.49	H.Bond
A	Water	771	HOH	O	O3B	A	601	2.91	H.Bond

2 / B

> Structure: HLLLLSHLLLH
> Sequence: SLSGIDGDLSNGGQI

TPP
/(601)

[+]

> Graphics rep1:

[+]

> Graphics rep2:

[+]

Protein Chain	Prot SSE	Res Nbr	Res Name	RsAt.Name	LgAt.Name	Lg Chain	Lg Nbr	Bnd Len	Bnd Type
B	390-401 H: 1	391	SER	C	O2B	B	601	3.84	van der Waals
B	390-401 H: 1	391	SER	CB	S1	B	601	3.62	van der Waals
B	390-401 H: 1	391	SER	CB	C7	B	601	3.89	van der Waals
B	390-401 H: 1	391	SER	CB	O3A	B	601	3.58	van der Waals
B	390-401 H: 1	391	SER	CB	PB	B	601	3.62
B	390-401 H: 1	391	SER	CB	O2B	B	601	3.06	van der Waals
B	390-401 H: 1	391	SER	CB	O3B	B	601	3.46	van der Waals
B	390-401 H: 1	391	SER	OG	S1	B	601	3.84
B	390-401 H: 1	391	SER	OG	C7	B	601	3.91	van der Waals
B	390-401 H: 1	391	SER	OG	O3A	B	601	3.35	H.Bond
B	390-401 H: 1	391	SER	OG	PB	B	601	2.79
B	390-401 H: 1	391	SER	OG	O2B	B	601	2.3	H.Bond
B	390-401 H: 1	391	SER	OG	O3B	B	601	2.34	H.Bond
B	390-401 H: 1	392	LEU	N	O2B	B	601	2.82	H.Bond
B	390-401 H: 1	392	LEU	CA	O2B	B	601	3.52	van der Waals
B	390-401 H: 1	392	LEU	CB	O2B	B	601	3.1	van der Waals
B	390-401 H: 1	392	LEU	CG	O2B	B	601	3.28	van der Waals
B	390-401 H: 1	392	LEU	CD1	O2B	B	601	3.72	van der Waals
B	No SSE	416	SER	C	N4*	B	601	3.81	H.Bond
B	No SSE	416	SER	O	C4*	B	601	3.95	van der Waals
B	No SSE	416	SER	O	N4*	B	601	2.95	H.Bond
B	No SSE	417	GLY	CA	N3*	B	601	3.17	H.Bond
B	No SSE	417	GLY	CA	C4*	B	601	3.96	van der Waals
B	No SSE	417	GLY	CA	N4*	B	601	3.81	H.Bond
B	No SSE	417	GLY	C	N3*	B	601	3.59	H.Bond
B	No SSE	418	ILE	N	C2*	B	601	3.69	H.Bond
B	No SSE	418	ILE	N	CM2	B	601	3.87	H.Bond
B	No SSE	418	ILE	N	N3*	B	601	3.04	H.Bond
B	No SSE	418	ILE	N	C4*	B	601	3.68	H.Bond
B	No SSE	418	ILE	N	N4*	B	601	3.84	H.Bond
B	No SSE	418	ILE	CD1	C7	B	601	3.99	van der Waals
B	No SSE	419	ASP	N	CM2	B	601	3.79	H.Bond
B	No SSE	419	ASP	CB	CM2	B	601	3.44	van der Waals
B	No SSE	419	ASP	CG	CM2	B	601	3.52	van der Waals
B	No SSE	419	ASP	OD1	CM2	B	601	3.46	van der Waals
B	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O2A	B	601	3.59	van der Waals
B	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O3A	B	601	3.81	van der Waals
B	436-441 S: 1	441	GLY	C	PA	B	601	3.91
B	436-441 S: 1	441	GLY	C	O1A	B	601	3.68	van der Waals
B	436-441 S: 1	441	GLY	C	O2A	B	601	3.25	van der Waals
B	436-441 S: 1	441	GLY	O	O2A	B	601	3.22	H.Bond
B	442-448 H: 1	442	ASP	N	O1A	B	601	3.28	H.Bond
B	442-448 H: 1	442	ASP	N	O2A	B	601	3.74	H.Bond
B	442-448 H: 1	442	ASP	CA	O1A	B	601	3.84	van der Waals
B	442-448 H: 1	442	ASP	C	O1A	B	601	3.85	van der Waals
B	442-448 H: 1	442	ASP	CG	O1A	B	601	3.14	van der Waals
B	442-448 H: 1	442	ASP	OD1	PA	B	601	3.99
B	442-448 H: 1	442	ASP	OD1	O1A	B	601	2.52	H.Bond
B	442-448 H: 1	442	ASP	OD1	O1B	B	601	3.76	H.Bond
B	442-448 H: 1	442	ASP	OD2	O1A	B	601	3.61	H.Bond
B	442-448 H: 1	443	LEU	N	PA	B	601	3.7
B	442-448 H: 1	443	LEU	N	O1A	B	601	3.01	H.Bond
B	442-448 H: 1	443	LEU	N	O2A	B	601	3.3	H.Bond
B	442-448 H: 1	443	LEU	CA	O1A	B	601	3.91	van der Waals
B	442-448 H: 1	443	LEU	CA	O2A	B	601	3.63	van der Waals
B	442-448 H: 1	443	LEU	C	O2A	B	601	3.53	van der Waals
B	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O7	B	601	3.62	van der Waals
B	442-448 H: 1	443	LEU	CB	PA	B	601	3.84
B	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O1A	B	601	3.76	van der Waals
B	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O2A	B	601	3.6	van der Waals
B	442-448 H: 1	443	LEU	CG	O7	B	601	3.84	van der Waals
B	442-448 H: 1	443	LEU	CG	O1A	B	601	3.94	van der Waals
B	442-448 H: 1	443	LEU	CD1	O7	B	601	3.69	van der Waals
B	442-448 H: 1	444	SER	N	O2A	B	601	2.69	H.Bond
B	442-448 H: 1	444	SER	CA	O2A	B	601	3.49	van der Waals
B	442-448 H: 1	444	SER	CB	O2A	B	601	3.22	van der Waals
B	442-448 H: 1	444	SER	OG	O2A	B	601	2.8	H.Bond
B	No SSE	469	ASN	CG	O1B	B	601	3.35	van der Waals
B	No SSE	469	ASN	OD1	O1A	B	601	3.98	H.Bond
B	No SSE	469	ASN	OD1	O1B	B	601	3	H.Bond
B	No SSE	469	ASN	ND2	O1B	B	601	2.91	H.Bond
B	No SSE	471	GLY	C	O1A	B	601	3.64	van der Waals
B	No SSE	471	GLY	O	PA	B	601	3.88
B	No SSE	471	GLY	O	O1A	B	601	2.77	H.Bond
B	No SSE	471	GLY	O	O1B	B	601	3.03	H.Bond
B	No SSE	472	GLY	CA	C6	B	601	3.86	van der Waals
B	No SSE	472	GLY	CA	O7	B	601	3.34	van der Waals
B	No SSE	472	GLY	CA	O3B	B	601	3.38	van der Waals
B	No SSE	472	GLY	C	O3B	B	601	3.29	van der Waals
B	No SSE	472	GLY	O	O3B	B	601	3.89	H.Bond
B	473-478 H: 1	473	GLN	N	PB	B	601	3.93
B	473-478 H: 1	473	GLN	N	O1B	B	601	3.42	H.Bond
B	473-478 H: 1	473	GLN	N	O3B	B	601	3.27	H.Bond
B	473-478 H: 1	474	ILE	N	O3B	B	601	3.38	H.Bond
B	473-478 H: 1	474	ILE	CB	O3B	B	601	3.86	van der Waals
B	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	S1	B	601	3.54	van der Waals
B	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	C6	B	601	3.94	van der Waals
B	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	O3B	B	601	3.34	van der Waals

3 / I

> Structure: HLLLLSHLLLH
> Sequence: SLSGIDGDLSYNGGQIF

TPP
/(601)

[+]

> Graphics rep1:

[+]

> Graphics rep2:

[+]

Protein Chain	Prot SSE	Res Nbr	Res Name	RsAt.Name	LgAt.Name	Lg Chain	Lg Nbr	Bnd Len	Bnd Type
I	390-401 H: 1	391	SER	CB	S1	I	601	3.59	van der Waals
I	390-401 H: 1	391	SER	CB	O3A	I	601	3.35	van der Waals
I	390-401 H: 1	391	SER	CB	PB	I	601	3.86
I	390-401 H: 1	391	SER	CB	O1B	I	601	3.92	van der Waals
I	390-401 H: 1	391	SER	CB	O2B	I	601	3.51	van der Waals
I	390-401 H: 1	391	SER	OG	S1	I	601	3.7
I	390-401 H: 1	391	SER	OG	O3A	I	601	3.01	H.Bond
I	390-401 H: 1	391	SER	OG	PB	I	601	2.99
I	390-401 H: 1	391	SER	OG	O1B	I	601	3.17	H.Bond
I	390-401 H: 1	391	SER	OG	O2B	I	601	2.25	H.Bond
I	390-401 H: 1	392	LEU	N	O1B	I	601	3.32	H.Bond
I	390-401 H: 1	392	LEU	N	O2B	I	601	3.94	H.Bond
I	390-401 H: 1	392	LEU	CA	O1B	I	601	3.8	van der Waals
I	390-401 H: 1	392	LEU	CB	O1B	I	601	3.23	van der Waals
I	390-401 H: 1	392	LEU	CG	O1B	I	601	3.52	van der Waals
I	390-401 H: 1	392	LEU	CG	O2B	I	601	3.99	van der Waals
I	390-401 H: 1	392	LEU	CD1	O1B	I	601	3.9	van der Waals
I	No SSE	416	SER	O	N3*	I	601	3.93	H.Bond
I	No SSE	416	SER	O	C4*	I	601	3.97	van der Waals
I	No SSE	416	SER	O	N4*	I	601	3.14	H.Bond
I	No SSE	417	GLY	CA	N3*	I	601	3.59	H.Bond
I	No SSE	417	GLY	C	N3*	I	601	3.99	H.Bond
I	No SSE	418	ILE	N	C2*	I	601	3.92	H.Bond
I	No SSE	418	ILE	N	CM2	I	601	3.98	H.Bond
I	No SSE	418	ILE	N	N3*	I	601	3.34	H.Bond
I	No SSE	418	ILE	CG1	N1*	I	601	3.8	H.Bond
I	No SSE	418	ILE	CG1	C2*	I	601	3.5	van der Waals
I	No SSE	418	ILE	CG1	N3*	I	601	3.55	H.Bond
I	No SSE	418	ILE	CG1	C4*	I	601	3.88	van der Waals
I	No SSE	418	ILE	CD1	CM4	I	601	3.67	van der Waals
I	No SSE	419	ASP	CB	CM2	I	601	3.76	van der Waals
I	No SSE	419	ASP	CG	CM2	I	601	3.52	van der Waals
I	No SSE	419	ASP	OD1	CM2	I	601	3.39	van der Waals
I	436-441 S: 1	441	GLY	N	O1A	I	601	3.98	H.Bond
I	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O1A	I	601	3.39	van der Waals
I	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O2A	I	601	3.97	van der Waals
I	436-441 S: 1	441	GLY	C	O1A	I	601	3.38	van der Waals
I	436-441 S: 1	441	GLY	C	O2A	I	601	3.83	van der Waals
I	436-441 S: 1	441	GLY	O	O1A	I	601	3.7	H.Bond
I	442-448 H: 1	442	ASP	N	O1A	I	601	3.75	H.Bond
I	442-448 H: 1	442	ASP	N	O2A	I	601	3.33	H.Bond
I	442-448 H: 1	442	ASP	CG	O2A	I	601	3.45	van der Waals
I	442-448 H: 1	442	ASP	OD1	O2A	I	601	3.38	H.Bond
I	442-448 H: 1	442	ASP	OD2	O2A	I	601	3.49	H.Bond
I	442-448 H: 1	443	LEU	N	PA	I	601	3.85
I	442-448 H: 1	443	LEU	N	O1A	I	601	3.37	H.Bond
I	442-448 H: 1	443	LEU	N	O2A	I	601	3.32	H.Bond
I	442-448 H: 1	443	LEU	CA	O1A	I	601	3.77	van der Waals
I	442-448 H: 1	443	LEU	C	O1A	I	601	3.71	van der Waals
I	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O7	I	601	3.47	van der Waals
I	442-448 H: 1	443	LEU	CB	PA	I	601	3.97
I	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O1A	I	601	3.82	van der Waals
I	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O2A	I	601	3.97	van der Waals
I	442-448 H: 1	443	LEU	CG	O7	I	601	3.72	van der Waals
I	442-448 H: 1	443	LEU	CG	O2A	I	601	3.9	van der Waals
I	442-448 H: 1	443	LEU	CD1	O7	I	601	3.46	van der Waals
I	442-448 H: 1	444	SER	N	O1A	I	601	2.85	H.Bond
I	442-448 H: 1	444	SER	CA	O1A	I	601	3.72	van der Waals
I	442-448 H: 1	444	SER	CB	O1A	I	601	3.45	van der Waals
I	442-448 H: 1	444	SER	OG	O1A	I	601	3.15	H.Bond
I	442-448 H: 1	447	TYR	CE2	CM2	I	601	3.86	van der Waals
I	442-448 H: 1	447	TYR	OH	CM2	I	601	3.94	van der Waals
I	No SSE	469	ASN	CG	O3B	I	601	3.13	van der Waals
I	No SSE	469	ASN	OD1	O2A	I	601	3.78	H.Bond
I	No SSE	469	ASN	OD1	O3B	I	601	2.83	H.Bond
I	No SSE	469	ASN	ND2	PB	I	601	3.89
I	No SSE	469	ASN	ND2	O1B	I	601	3.73	H.Bond
I	No SSE	469	ASN	ND2	O3B	I	601	2.69	H.Bond
I	No SSE	471	GLY	C	O2A	I	601	3.81	van der Waals
I	No SSE	471	GLY	O	PA	I	601	3.93
I	No SSE	471	GLY	O	O2A	I	601	2.82	H.Bond
I	No SSE	471	GLY	O	O3B	I	601	3.2	H.Bond
I	No SSE	472	GLY	CA	C6	I	601	3.75	van der Waals
I	No SSE	472	GLY	CA	O7	I	601	3.51	van der Waals
I	No SSE	472	GLY	CA	O2B	I	601	3.65	van der Waals
I	No SSE	472	GLY	CA	O3B	I	601	3.82	van der Waals
I	No SSE	472	GLY	C	O2B	I	601	3.41	van der Waals
I	No SSE	472	GLY	C	O3B	I	601	3.8	van der Waals
I	473-478 H: 1	473	GLN	N	PB	I	601	3.59
I	473-478 H: 1	473	GLN	N	O2B	I	601	3	H.Bond
I	473-478 H: 1	473	GLN	N	O3B	I	601	2.94	H.Bond
I	473-478 H: 1	473	GLN	CA	O2B	I	601	3.84	van der Waals
I	473-478 H: 1	473	GLN	CA	O3B	I	601	3.82	van der Waals
I	473-478 H: 1	473	GLN	C	O2B	I	601	3.79	van der Waals
I	473-478 H: 1	473	GLN	CB	O3B	I	601	3.8	van der Waals
I	473-478 H: 1	474	ILE	N	O2B	I	601	2.96	H.Bond
I	473-478 H: 1	474	ILE	CA	O2B	I	601	3.83	van der Waals
I	473-478 H: 1	474	ILE	CB	O2B	I	601	3.62	van der Waals
I	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	S1	I	601	3.42	van der Waals
I	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	O2B	I	601	3.51	van der Waals
I	473-478 H: 1	475	PHE	CZ	C5	I	601	3.95	van der Waals
I	473-478 H: 1	475	PHE	CZ	C4	I	601	3.84	van der Waals

4 / J

> Structure: HLLLLSHLLLH +1w
> Sequence: SLSGIDGDLSYNGGQIF

TPP
/(601)

[+]

> Graphics rep1:

[+]

> Graphics rep2:

[+]

Protein Chain	Prot SSE	Res Nbr	Res Name	RsAt.Name	LgAt.Name	Lg Chain	Lg Nbr	Bnd Len	Bnd Type
J	391-401 H: 1	391	SER	CB	S1	J	601	3.91	van der Waals
J	391-401 H: 1	391	SER	CB	C7	J	601	3.85	van der Waals
J	391-401 H: 1	391	SER	CB	O3A	J	601	3.39	van der Waals
J	391-401 H: 1	391	SER	CB	PB	J	601	3.82
J	391-401 H: 1	391	SER	CB	O2B	J	601	3.72	van der Waals
J	391-401 H: 1	391	SER	CB	O3B	J	601	3.47	van der Waals
J	391-401 H: 1	391	SER	OG	S1	J	601	3.09
J	391-401 H: 1	391	SER	OG	C5	J	601	3.77	van der Waals
J	391-401 H: 1	391	SER	OG	C6	J	601	3.32	van der Waals
J	391-401 H: 1	391	SER	OG	C7	J	601	3.23	van der Waals
J	391-401 H: 1	391	SER	OG	O7	J	601	3.81	H.Bond
J	391-401 H: 1	391	SER	OG	O3A	J	601	3.35	H.Bond
J	391-401 H: 1	391	SER	OG	PB	J	601	3.42
J	391-401 H: 1	391	SER	OG	O2B	J	601	3.68	H.Bond
J	391-401 H: 1	391	SER	OG	O3B	J	601	2.55	H.Bond
J	391-401 H: 1	392	LEU	N	O2B	J	601	3.42	H.Bond
J	391-401 H: 1	392	LEU	CA	O2B	J	601	3.93	van der Waals
J	391-401 H: 1	392	LEU	CB	O2B	J	601	3.28	van der Waals
J	391-401 H: 1	392	LEU	CG	O2B	J	601	3.35	van der Waals
J	391-401 H: 1	392	LEU	CD1	O2B	J	601	3.56	van der Waals
J	No SSE	416	SER	C	N4*	J	601	3.88	H.Bond
J	No SSE	416	SER	O	C4*	J	601	3.93	van der Waals
J	No SSE	416	SER	O	N4*	J	601	2.85	H.Bond
J	No SSE	417	GLY	CA	N3*	J	601	3.54	H.Bond
J	No SSE	417	GLY	C	N3*	J	601	3.94	H.Bond
J	No SSE	418	ILE	N	N3*	J	601	3.32	H.Bond
J	No SSE	418	ILE	N	C4*	J	601	3.98	H.Bond
J	No SSE	418	ILE	N	N4*	J	601	3.98	H.Bond
J	No SSE	418	ILE	CG1	N1*	J	601	3.95	H.Bond
J	No SSE	418	ILE	CG1	C2*	J	601	3.66	van der Waals
J	No SSE	418	ILE	CG1	N3*	J	601	3.67	H.Bond
J	No SSE	418	ILE	CG2	C7	J	601	3.9	van der Waals
J	No SSE	418	ILE	CD1	C4	J	601	3.91	van der Waals
J	No SSE	418	ILE	CD1	CM4	J	601	3.54	van der Waals
J	No SSE	419	ASP	CB	CM2	J	601	3.73	van der Waals
J	No SSE	419	ASP	CG	CM2	J	601	3.66	van der Waals
J	No SSE	419	ASP	OD2	CM2	J	601	3.76	van der Waals
J	436-441 S: 1	441	GLY	N	O2A	J	601	3.83	H.Bond
J	436-441 S: 1	441	GLY	CA	PA	J	601	3.7
J	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O1A	J	601	3.68	van der Waals
J	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O2A	J	601	3.08	van der Waals
J	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O3A	J	601	3.72	van der Waals
J	436-441 S: 1	441	GLY	C	O1A	J	601	3.64	van der Waals
J	436-441 S: 1	441	GLY	C	O2A	J	601	3.34	van der Waals
J	436-441 S: 1	441	GLY	O	O2A	J	601	3.83	H.Bond
J	442-448 H: 1	442	ASP	N	O1A	J	601	3.15	H.Bond
J	442-448 H: 1	442	ASP	N	O2A	J	601	3.76	H.Bond
J	442-448 H: 1	442	ASP	CG	O1A	J	601	3.57	van der Waals
J	442-448 H: 1	442	ASP	OD1	O1A	J	601	3.03	H.Bond
J	442-448 H: 1	443	LEU	N	PA	J	601	3.82
J	442-448 H: 1	443	LEU	N	O1A	J	601	3.03	H.Bond
J	442-448 H: 1	443	LEU	N	O2A	J	601	3.54	H.Bond
J	442-448 H: 1	443	LEU	CA	O1A	J	601	3.8	van der Waals
J	442-448 H: 1	443	LEU	CA	O2A	J	601	3.84	van der Waals
J	442-448 H: 1	443	LEU	C	O2A	J	601	3.77	van der Waals
J	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O7	J	601	3.57	van der Waals
J	442-448 H: 1	443	LEU	CB	PA	J	601	3.77
J	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O1A	J	601	3.52	van der Waals
J	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O2A	J	601	3.78	van der Waals
J	442-448 H: 1	443	LEU	CG	O1A	J	601	3.88	van der Waals
J	442-448 H: 1	444	SER	N	O2A	J	601	2.88	H.Bond
J	442-448 H: 1	444	SER	CA	O2A	J	601	3.72	van der Waals
J	442-448 H: 1	444	SER	CB	O2A	J	601	3.5	van der Waals
J	442-448 H: 1	444	SER	OG	O2A	J	601	2.77	H.Bond
J	442-448 H: 1	447	TYR	CE2	CM2	J	601	3.78	van der Waals
J	442-448 H: 1	447	TYR	OH	CM2	J	601	3.78	van der Waals
J	No SSE	469	ASN	CG	O1B	J	601	3.42	van der Waals
J	No SSE	469	ASN	OD1	O1B	J	601	2.92	H.Bond
J	No SSE	469	ASN	ND2	O1B	J	601	3.18	H.Bond
J	No SSE	469	ASN	ND2	O2B	J	601	3.94	H.Bond
J	No SSE	471	GLY	C	O1B	J	601	3.9	van der Waals
J	No SSE	471	GLY	O	O1A	J	601	3.43	H.Bond
J	No SSE	471	GLY	O	O1B	J	601	2.87	H.Bond
J	No SSE	472	GLY	CA	O7	J	601	3.61	van der Waals
J	No SSE	472	GLY	CA	O1B	J	601	3.67	van der Waals
J	No SSE	472	GLY	CA	O3B	J	601	3.61	van der Waals
J	No SSE	472	GLY	C	O1B	J	601	3.72	van der Waals
J	No SSE	472	GLY	C	O3B	J	601	3.46	van der Waals
J	473-478 H: 1	473	GLN	N	PB	J	601	3.73
J	473-478 H: 1	473	GLN	N	O1B	J	601	3.01	H.Bond
J	473-478 H: 1	473	GLN	N	O3B	J	601	3.39	H.Bond
J	473-478 H: 1	473	GLN	CA	O1B	J	601	3.93	van der Waals
J	473-478 H: 1	473	GLN	CB	O1B	J	601	3.91	van der Waals
J	473-478 H: 1	474	ILE	N	O3B	J	601	3.15	H.Bond
J	473-478 H: 1	474	ILE	CA	O3B	J	601	3.91	van der Waals
J	473-478 H: 1	474	ILE	CB	O3B	J	601	3.56	van der Waals
J	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	S1	J	601	3.51	van der Waals
J	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	C5	J	601	3.85	van der Waals
J	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	C6	J	601	3.58	van der Waals
J	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	O3B	J	601	3.28	van der Waals
J	473-478 H: 1	475	PHE	CE2	C4	J	601	3.89	van der Waals
J	473-478 H: 1	475	PHE	CE2	CM4	J	601	3.86	van der Waals
J	473-478 H: 1	475	PHE	CZ	C4	J	601	3.86	van der Waals
J	Water	723	HOH	O	O3A	J	601	3.42	H.Bond
J	Water	723	HOH	O	PB	J	601	3.04
J	Water	723	HOH	O	O1B	J	601	2.93	H.Bond
J	Water	723	HOH	O	O2B	J	601	2.44	H.Bond

5 / R

> Structure: HLLLLSHLLLH
> Sequence: SLSGIDGDLSYNGGQI

TPP
/(601)

[+]

> Graphics rep1:

[+]

> Graphics rep2:

[+]

Protein Chain	Prot SSE	Res Nbr	Res Name	RsAt.Name	LgAt.Name	Lg Chain	Lg Nbr	Bnd Len	Bnd Type
R	391-401 H: 1	391	SER	CB	O3A	R	601	3.39	van der Waals
R	391-401 H: 1	391	SER	CB	PB	R	601	3.74
R	391-401 H: 1	391	SER	CB	O1B	R	601	3.27	van der Waals
R	391-401 H: 1	391	SER	CB	O2B	R	601	3.83	van der Waals
R	391-401 H: 1	391	SER	OG	O3A	R	601	2.94	H.Bond
R	391-401 H: 1	391	SER	OG	PB	R	601	2.71
R	391-401 H: 1	391	SER	OG	O1B	R	601	2.24	H.Bond
R	391-401 H: 1	391	SER	OG	O2B	R	601	2.6	H.Bond
R	391-401 H: 1	392	LEU	N	O1B	R	601	3.13	H.Bond
R	391-401 H: 1	392	LEU	CA	O1B	R	601	3.73	van der Waals
R	391-401 H: 1	392	LEU	CB	O1B	R	601	3.15	van der Waals
R	391-401 H: 1	392	LEU	CG	O1B	R	601	3.38	van der Waals
R	391-401 H: 1	392	LEU	CD1	O1B	R	601	3.38	van der Waals
R	No SSE	416	SER	O	N4*	R	601	3.2	H.Bond
R	No SSE	417	GLY	CA	N3*	R	601	3.39	H.Bond
R	No SSE	417	GLY	C	N3*	R	601	3.75	H.Bond
R	No SSE	418	ILE	N	C2*	R	601	3.64	H.Bond
R	No SSE	418	ILE	N	CM2	R	601	3.86	H.Bond
R	No SSE	418	ILE	N	N3*	R	601	3.11	H.Bond
R	No SSE	418	ILE	N	C4*	R	601	3.78	H.Bond
R	No SSE	418	ILE	CG1	N1*	R	601	3.89	H.Bond
R	No SSE	418	ILE	CG1	C2*	R	601	3.9	van der Waals
R	No SSE	418	ILE	CG2	C4*	R	601	3.92	van der Waals
R	No SSE	418	ILE	CG2	N4*	R	601	3.97	H.Bond
R	No SSE	418	ILE	CG2	S1	R	601	3.99	van der Waals
R	No SSE	418	ILE	CD1	CM4	R	601	3.79	van der Waals
R	No SSE	418	ILE	CD1	C7	R	601	3.68	van der Waals
R	No SSE	419	ASP	N	CM2	R	601	3.86	H.Bond
R	No SSE	419	ASP	CB	CM2	R	601	3.64	van der Waals
R	No SSE	419	ASP	CG	CM2	R	601	3.6	van der Waals
R	No SSE	419	ASP	OD1	CM2	R	601	3.35	van der Waals
R	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O1A	R	601	3.68	van der Waals
R	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O2A	R	601	3.88	van der Waals
R	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O3A	R	601	3.85	van der Waals
R	436-441 S: 1	441	GLY	C	PA	R	601	3.85
R	436-441 S: 1	441	GLY	C	O1A	R	601	3.41	van der Waals
R	436-441 S: 1	441	GLY	C	O2A	R	601	3.4	van der Waals
R	436-441 S: 1	441	GLY	O	O1A	R	601	3.26	H.Bond
R	436-441 S: 1	441	GLY	O	O2A	R	601	3.91	H.Bond
R	442-448 H: 1	442	ASP	N	O2A	R	601	3.15	H.Bond
R	442-448 H: 1	442	ASP	CA	O2A	R	601	3.78	van der Waals
R	442-448 H: 1	442	ASP	C	O2A	R	601	3.83	van der Waals
R	442-448 H: 1	442	ASP	CG	O2A	R	601	3.27	van der Waals
R	442-448 H: 1	442	ASP	OD1	O2A	R	601	2.91	H.Bond
R	442-448 H: 1	442	ASP	OD1	O3B	R	601	3.88	H.Bond
R	442-448 H: 1	442	ASP	OD2	O2A	R	601	3.56	H.Bond
R	442-448 H: 1	443	LEU	N	PA	R	601	3.94
R	442-448 H: 1	443	LEU	N	O1A	R	601	3.81	H.Bond
R	442-448 H: 1	443	LEU	N	O2A	R	601	3.03	H.Bond
R	442-448 H: 1	443	LEU	CA	O2A	R	601	3.86	van der Waals
R	442-448 H: 1	443	LEU	C	O1A	R	601	3.82	van der Waals
R	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O7	R	601	3.63	van der Waals
R	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O2A	R	601	3.69	van der Waals
R	442-448 H: 1	443	LEU	CG	O7	R	601	3.81	van der Waals
R	442-448 H: 1	443	LEU	CG	O2A	R	601	3.82	van der Waals
R	442-448 H: 1	443	LEU	CD1	O7	R	601	3.53	van der Waals
R	442-448 H: 1	444	SER	N	O1A	R	601	2.91	H.Bond
R	442-448 H: 1	444	SER	CA	O1A	R	601	3.68	van der Waals
R	442-448 H: 1	444	SER	CB	O1A	R	601	3.51	van der Waals
R	442-448 H: 1	444	SER	OG	O1A	R	601	2.69	H.Bond
R	442-448 H: 1	447	TYR	CE2	N1*	R	601	3.77	H.Bond
R	442-448 H: 1	447	TYR	CE2	CM2	R	601	3.83	van der Waals
R	No SSE	469	ASN	CG	O3B	R	601	3.36	van der Waals
R	No SSE	469	ASN	OD1	O3B	R	601	3.01	H.Bond
R	No SSE	469	ASN	ND2	O3B	R	601	2.91	H.Bond
R	No SSE	471	GLY	C	O2A	R	601	3.83	van der Waals
R	No SSE	471	GLY	C	O3B	R	601	3.88	van der Waals
R	No SSE	471	GLY	O	O7	R	601	3.99	H.Bond
R	No SSE	471	GLY	O	PA	R	601	3.88
R	No SSE	471	GLY	O	O2A	R	601	2.95	H.Bond
R	No SSE	471	GLY	O	PB	R	601	3.79
R	No SSE	471	GLY	O	O2B	R	601	3.94	H.Bond
R	No SSE	471	GLY	O	O3B	R	601	2.77	H.Bond
R	No SSE	472	GLY	CA	C6	R	601	3.68	van der Waals
R	No SSE	472	GLY	CA	O7	R	601	3.45	van der Waals
R	No SSE	472	GLY	CA	O2B	R	601	3.04	van der Waals
R	No SSE	472	GLY	CA	O3B	R	601	3.94	van der Waals
R	No SSE	472	GLY	C	O2B	R	601	3.04	van der Waals
R	No SSE	472	GLY	O	O2B	R	601	3.78	H.Bond
R	473-478 H: 1	473	GLN	N	PB	R	601	3.72
R	473-478 H: 1	473	GLN	N	O2B	R	601	2.94	H.Bond
R	473-478 H: 1	473	GLN	N	O3B	R	601	3.32	H.Bond
R	473-478 H: 1	473	GLN	CA	O2B	R	601	3.99	van der Waals
R	473-478 H: 1	474	ILE	N	O2B	R	601	3.31	H.Bond
R	473-478 H: 1	474	ILE	CB	O2B	R	601	3.94	van der Waals
R	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	S1	R	601	3.67	van der Waals
R	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	C6	R	601	3.71	van der Waals
R	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	O2B	R	601	3.25	van der Waals

6 / S

> Structure: HLLLLSHLLLH +1w
> Sequence: SLSGIDGDLSYNGGQIF

TPP
/(601)

[+]

> Graphics rep1:

[+]

> Graphics rep2:

[+]

Protein Chain	Prot SSE	Res Nbr	Res Name	RsAt.Name	LgAt.Name	Lg Chain	Lg Nbr	Bnd Len	Bnd Type
S	391-401 H: 1	391	SER	CB	S1	S	601	3.64	van der Waals
S	391-401 H: 1	391	SER	CB	C7	S	601	3.89	van der Waals
S	391-401 H: 1	391	SER	CB	O3A	S	601	3.97	van der Waals
S	391-401 H: 1	391	SER	CB	PB	S	601	3.95
S	391-401 H: 1	391	SER	CB	O2B	S	601	3.71	van der Waals
S	391-401 H: 1	391	SER	CB	O3B	S	601	3.37	van der Waals
S	391-401 H: 1	391	SER	OG	S1	S	601	3.21
S	391-401 H: 1	391	SER	OG	C6	S	601	3.91	van der Waals
S	391-401 H: 1	391	SER	OG	C7	S	601	3.75	van der Waals
S	391-401 H: 1	391	SER	OG	PB	S	601	3.74
S	391-401 H: 1	391	SER	OG	O2B	S	601	3.72	H.Bond
S	391-401 H: 1	391	SER	OG	O3B	S	601	2.69	H.Bond
S	391-401 H: 1	392	LEU	N	O2B	S	601	3.33	H.Bond
S	391-401 H: 1	392	LEU	CA	O2B	S	601	3.91	van der Waals
S	391-401 H: 1	392	LEU	CB	O2B	S	601	3.38	van der Waals
S	391-401 H: 1	392	LEU	CG	O2B	S	601	3.62	van der Waals
S	391-401 H: 1	392	LEU	CD1	O2B	S	601	3.81	van der Waals
S	No SSE	416	SER	O	N4*	S	601	3.18	H.Bond
S	No SSE	417	GLY	CA	N3*	S	601	3.66	H.Bond
S	No SSE	418	ILE	N	N3*	S	601	3.36	H.Bond
S	No SSE	418	ILE	CG1	N1*	S	601	3.77	H.Bond
S	No SSE	418	ILE	CG1	C2*	S	601	3.44	van der Waals
S	No SSE	418	ILE	CG1	CM2	S	601	3.95	van der Waals
S	No SSE	418	ILE	CG1	N3*	S	601	3.46	H.Bond
S	No SSE	418	ILE	CG1	C4*	S	601	3.77	van der Waals
S	No SSE	418	ILE	CD1	C4	S	601	3.91	van der Waals
S	No SSE	418	ILE	CD1	CM4	S	601	3.61	van der Waals
S	No SSE	419	ASP	CB	CM2	S	601	3.74	van der Waals
S	No SSE	419	ASP	CG	CM2	S	601	3.87	van der Waals
S	No SSE	419	ASP	OD1	CM2	S	601	3.58	van der Waals
S	436-441 S: 1	441	GLY	N	O2A	S	601	3.96	H.Bond
S	436-441 S: 1	441	GLY	CA	PA	S	601	3.73
S	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O1A	S	601	3.79	van der Waals
S	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O2A	S	601	3.32	van der Waals
S	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O3A	S	601	3.45	van der Waals
S	436-441 S: 1	441	GLY	C	PA	S	601	3.84
S	436-441 S: 1	441	GLY	C	O1A	S	601	3.61	van der Waals
S	436-441 S: 1	441	GLY	C	O2A	S	601	3.23	van der Waals
S	436-441 S: 1	441	GLY	O	O2A	S	601	3.53	H.Bond
S	442-448 H: 1	442	ASP	N	PA	S	601	3.81
S	442-448 H: 1	442	ASP	N	O1A	S	601	3.05	H.Bond
S	442-448 H: 1	442	ASP	N	O2A	S	601	3.6	H.Bond
S	442-448 H: 1	442	ASP	CA	O1A	S	601	3.76	van der Waals
S	442-448 H: 1	442	ASP	C	O1A	S	601	3.88	van der Waals
S	442-448 H: 1	442	ASP	CG	O1A	S	601	3.25	van der Waals
S	442-448 H: 1	442	ASP	OD1	O1A	S	601	2.9	H.Bond
S	442-448 H: 1	442	ASP	OD2	O1A	S	601	3.57	H.Bond
S	442-448 H: 1	443	LEU	N	PA	S	601	3.61
S	442-448 H: 1	443	LEU	N	O1A	S	601	3.06	H.Bond
S	442-448 H: 1	443	LEU	N	O2A	S	601	3.25	H.Bond
S	442-448 H: 1	443	LEU	CA	O2A	S	601	3.68	van der Waals
S	442-448 H: 1	443	LEU	C	O2A	S	601	3.59	van der Waals
S	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O7	S	601	3.58	van der Waals
S	442-448 H: 1	443	LEU	CB	PA	S	601	3.88
S	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O1A	S	601	3.87	van der Waals
S	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O2A	S	601	3.74	van der Waals
S	442-448 H: 1	443	LEU	CG	O7	S	601	3.87	van der Waals
S	442-448 H: 1	443	LEU	CG	O1A	S	601	3.9	van der Waals
S	442-448 H: 1	443	LEU	CD1	O7	S	601	3.83	van der Waals
S	442-448 H: 1	444	SER	N	O2A	S	601	2.79	H.Bond
S	442-448 H: 1	444	SER	CA	O2A	S	601	3.6	van der Waals
S	442-448 H: 1	444	SER	CB	O2A	S	601	3.34	van der Waals
S	442-448 H: 1	444	SER	OG	O2A	S	601	2.74	H.Bond
S	442-448 H: 1	447	TYR	CE2	CM2	S	601	3.78	van der Waals
S	442-448 H: 1	447	TYR	CZ	CM2	S	601	3.83	van der Waals
S	442-448 H: 1	447	TYR	OH	CM2	S	601	3.57	van der Waals
S	No SSE	469	ASN	CG	O1B	S	601	3.11	van der Waals
S	No SSE	469	ASN	OD1	O1A	S	601	3.91	H.Bond
S	No SSE	469	ASN	OD1	O1B	S	601	2.95	H.Bond
S	No SSE	469	ASN	ND2	PB	S	601	3.72
S	No SSE	469	ASN	ND2	O1B	S	601	2.51	H.Bond
S	No SSE	469	ASN	ND2	O2B	S	601	3.82	H.Bond
S	No SSE	471	GLY	C	O1A	S	601	3.94	van der Waals
S	No SSE	471	GLY	C	O1B	S	601	3.92	van der Waals
S	No SSE	471	GLY	O	O1A	S	601	3.19	H.Bond
S	No SSE	471	GLY	O	O1B	S	601	2.84	H.Bond
S	No SSE	472	GLY	CA	C6	S	601	3.84	van der Waals
S	No SSE	472	GLY	CA	O7	S	601	3.37	van der Waals
S	No SSE	472	GLY	CA	O1B	S	601	3.73	van der Waals
S	No SSE	472	GLY	CA	O3B	S	601	3.36	van der Waals
S	No SSE	472	GLY	C	O1B	S	601	3.71	van der Waals
S	No SSE	472	GLY	C	O3B	S	601	3.38	van der Waals
S	473-478 H: 1	473	GLN	N	PB	S	601	3.73
S	473-478 H: 1	473	GLN	N	O1B	S	601	2.94	H.Bond
S	473-478 H: 1	473	GLN	N	O3B	S	601	3.35	H.Bond
S	473-478 H: 1	473	GLN	CA	O1B	S	601	3.88	van der Waals
S	473-478 H: 1	473	GLN	CB	O1B	S	601	3.91	van der Waals
S	473-478 H: 1	474	ILE	N	O3B	S	601	3.42	H.Bond
S	473-478 H: 1	474	ILE	CB	O3B	S	601	3.81	van der Waals
S	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	S1	S	601	3.78	van der Waals
S	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	O3B	S	601	3.69	van der Waals
S	473-478 H: 1	475	PHE	CE2	C5	S	601	3.81	van der Waals
S	473-478 H: 1	475	PHE	CE2	C4	S	601	3.82	van der Waals
S	473-478 H: 1	475	PHE	CE2	CM4	S	601	3.92	van der Waals
S	473-478 H: 1	475	PHE	CE2	C6	S	601	3.9	van der Waals
S	473-478 H: 1	475	PHE	CZ	N3	S	601	3.99	H.Bond
S	473-478 H: 1	475	PHE	CZ	C5	S	601	3.97	van der Waals
S	473-478 H: 1	475	PHE	CZ	C4	S	601	3.77	van der Waals
S	Water	805	HOH	O	C7*	S	601	2.97	van der Waals
S	Water	805	HOH	O	N3	S	601	3.03	H.Bond
S	Water	805	HOH	O	C2	S	601	2.91	van der Waals

7 / Z

> Structure: HLLLLSHLLLH +2w
> Sequence: SLSGIDGDLSYNGGQIF

TPP
/(601)

[+]

> Graphics rep1:

[+]

> Graphics rep2:

[+]

Protein Chain	Prot SSE	Res Nbr	Res Name	RsAt.Name	LgAt.Name	Lg Chain	Lg Nbr	Bnd Len	Bnd Type
Z	391-401 H: 1	391	SER	CB	S1	Z	601	3.79	van der Waals
Z	391-401 H: 1	391	SER	CB	O3A	Z	601	3.34	van der Waals
Z	391-401 H: 1	391	SER	CB	PB	Z	601	3.73
Z	391-401 H: 1	391	SER	CB	O1B	Z	601	3.52	van der Waals
Z	391-401 H: 1	391	SER	CB	O2B	Z	601	3.47	van der Waals
Z	391-401 H: 1	391	SER	OG	S1	Z	601	3.36
Z	391-401 H: 1	391	SER	OG	C6	Z	601	3.53	van der Waals
Z	391-401 H: 1	391	SER	OG	C7	Z	601	3.76	van der Waals
Z	391-401 H: 1	391	SER	OG	O7	Z	601	3.93	H.Bond
Z	391-401 H: 1	391	SER	OG	O3A	Z	601	3.26	H.Bond
Z	391-401 H: 1	391	SER	OG	PB	Z	601	3.15
Z	391-401 H: 1	391	SER	OG	O1B	Z	601	3.21	H.Bond
Z	391-401 H: 1	391	SER	OG	O2B	Z	601	2.38	H.Bond
Z	391-401 H: 1	392	LEU	N	O1B	Z	601	3.18	H.Bond
Z	391-401 H: 1	392	LEU	CA	O1B	Z	601	3.7	van der Waals
Z	391-401 H: 1	392	LEU	CB	O1B	Z	601	3.01	van der Waals
Z	391-401 H: 1	392	LEU	CG	O1B	Z	601	3.35	van der Waals
Z	391-401 H: 1	392	LEU	CD1	O1B	Z	601	3.54	van der Waals
Z	No SSE	416	SER	O	N4*	Z	601	2.98	H.Bond
Z	No SSE	417	GLY	CA	N3*	Z	601	3.57	H.Bond
Z	No SSE	417	GLY	C	N3*	Z	601	3.84	H.Bond
Z	No SSE	418	ILE	N	C2*	Z	601	3.87	H.Bond
Z	No SSE	418	ILE	N	CM2	Z	601	3.98	H.Bond
Z	No SSE	418	ILE	N	N3*	Z	601	3.2	H.Bond
Z	No SSE	418	ILE	N	C4*	Z	601	3.93	H.Bond
Z	No SSE	418	ILE	CG1	N1*	Z	601	3.93	H.Bond
Z	No SSE	418	ILE	CG1	C2*	Z	601	3.66	van der Waals
Z	No SSE	418	ILE	CG1	N3*	Z	601	3.56	H.Bond
Z	No SSE	418	ILE	CG1	C4*	Z	601	3.77	van der Waals
Z	No SSE	418	ILE	CD1	CM4	Z	601	3.6	van der Waals
Z	No SSE	418	ILE	CD1	C7	Z	601	3.97	van der Waals
Z	No SSE	419	ASP	CB	CM2	Z	601	3.77	van der Waals
Z	No SSE	419	ASP	CG	CM2	Z	601	3.71	van der Waals
Z	No SSE	419	ASP	OD1	CM2	Z	601	3.95	van der Waals
Z	436-441 S: 1	441	GLY	CA	PA	Z	601	3.92
Z	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O1A	Z	601	3.41	van der Waals
Z	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O2A	Z	601	3.85	van der Waals
Z	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O3A	Z	601	3.94	van der Waals
Z	436-441 S: 1	441	GLY	C	O1A	Z	601	3.61	van der Waals
Z	436-441 S: 1	441	GLY	C	O2A	Z	601	3.81	van der Waals
Z	442-448 H: 1	442	ASP	N	O2A	Z	601	3.35	H.Bond
Z	442-448 H: 1	442	ASP	C	O2A	Z	601	3.97	van der Waals
Z	442-448 H: 1	442	ASP	CG	O2A	Z	601	3.55	van der Waals
Z	442-448 H: 1	442	ASP	OD1	O2A	Z	601	3.16	H.Bond
Z	442-448 H: 1	442	ASP	OD2	O2A	Z	601	3.92	H.Bond
Z	442-448 H: 1	443	LEU	N	PA	Z	601	3.82
Z	442-448 H: 1	443	LEU	N	O1A	Z	601	3.5	H.Bond
Z	442-448 H: 1	443	LEU	N	O2A	Z	601	3.05	H.Bond
Z	442-448 H: 1	443	LEU	CA	O1A	Z	601	3.76	van der Waals
Z	442-448 H: 1	443	LEU	CA	O2A	Z	601	3.86	van der Waals
Z	442-448 H: 1	443	LEU	C	O1A	Z	601	3.66	van der Waals
Z	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O7	Z	601	3.65	van der Waals
Z	442-448 H: 1	443	LEU	CB	PA	Z	601	3.82
Z	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O1A	Z	601	3.7	van der Waals
Z	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O2A	Z	601	3.64	van der Waals
Z	442-448 H: 1	443	LEU	CG	O2A	Z	601	3.88	van der Waals
Z	442-448 H: 1	444	SER	N	O1A	Z	601	2.77	H.Bond
Z	442-448 H: 1	444	SER	CA	O1A	Z	601	3.57	van der Waals
Z	442-448 H: 1	444	SER	CB	O1A	Z	601	3.38	van der Waals
Z	442-448 H: 1	444	SER	OG	PA	Z	601	3.92
Z	442-448 H: 1	444	SER	OG	O1A	Z	601	2.5	H.Bond
Z	442-448 H: 1	447	TYR	CE2	CM2	Z	601	3.98	van der Waals
Z	442-448 H: 1	447	TYR	OH	CM2	Z	601	3.75	van der Waals
Z	No SSE	469	ASN	CG	O3B	Z	601	3.5	van der Waals
Z	No SSE	469	ASN	OD1	O3B	Z	601	3.02	H.Bond
Z	No SSE	469	ASN	ND2	O3B	Z	601	3.26	H.Bond
Z	No SSE	471	GLY	C	O3B	Z	601	3.92	van der Waals
Z	No SSE	471	GLY	O	O2A	Z	601	3.64	H.Bond
Z	No SSE	471	GLY	O	O3B	Z	601	2.96	H.Bond
Z	No SSE	472	GLY	CA	C6	Z	601	3.84	van der Waals
Z	No SSE	472	GLY	CA	O7	Z	601	3.34	van der Waals
Z	No SSE	472	GLY	CA	O2B	Z	601	3.37	van der Waals
Z	No SSE	472	GLY	CA	O3B	Z	601	3.62	van der Waals
Z	No SSE	472	GLY	C	O2B	Z	601	3.29	van der Waals
Z	No SSE	472	GLY	C	O3B	Z	601	3.78	van der Waals
Z	No SSE	472	GLY	O	O2B	Z	601	3.99	H.Bond
Z	473-478 H: 1	473	GLN	N	PB	Z	601	3.67
Z	473-478 H: 1	473	GLN	N	O2B	Z	601	3.13	H.Bond
Z	473-478 H: 1	473	GLN	N	O3B	Z	601	3.05	H.Bond
Z	473-478 H: 1	474	ILE	N	O2B	Z	601	3.08	H.Bond
Z	473-478 H: 1	474	ILE	CA	O2B	Z	601	3.87	van der Waals
Z	473-478 H: 1	474	ILE	CB	O2B	Z	601	3.56	van der Waals
Z	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	S1	Z	601	3.61	van der Waals
Z	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	C6	Z	601	3.97	van der Waals
Z	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	O2B	Z	601	3.53	van der Waals
Z	473-478 H: 1	475	PHE	CE2	C5	Z	601	3.96	van der Waals
Z	473-478 H: 1	475	PHE	CE2	C4	Z	601	3.92	van der Waals
Z	Water	692	HOH	O	PB	Z	601	3.39
Z	Water	692	HOH	O	O1B	Z	601	2.64	H.Bond
Z	Water	692	HOH	O	O3B	Z	601	3.34	H.Bond
Z	Water	876	HOH	O	O2A	Z	601	3.16	H.Bond
Z	Water	876	HOH	O	O3A	Z	601	3.81	H.Bond
Z	Water	876	HOH	O	PB	Z	601	3.78
Z	Water	876	HOH	O	O3B	Z	601	3	H.Bond

8 / 1

> Structure: HLHSHLLLH +1w
> Sequence: SLSGIDGDLSYNGGQIF

TPP
/(601)

[+]

> Graphics rep1:

[+]

> Graphics rep2:

[+]

Protein Chain	Prot SSE	Res Nbr	Res Name	RsAt.Name	LgAt.Name	Lg Chain	Lg Nbr	Bnd Len	Bnd Type
1	390-401 H: 1	391	SER	CB	S1	1	601	3.75	van der Waals
1	390-401 H: 1	391	SER	CB	O3A	1	601	3.62	van der Waals
1	390-401 H: 1	391	SER	CB	PB	1	601	3.82
1	390-401 H: 1	391	SER	CB	O2B	1	601	3.69	van der Waals
1	390-401 H: 1	391	SER	CB	O3B	1	601	3.53	van der Waals
1	390-401 H: 1	391	SER	OG	S1	1	601	3.16
1	390-401 H: 1	391	SER	OG	C5	1	601	3.9	van der Waals
1	390-401 H: 1	391	SER	OG	C6	1	601	3.57	van der Waals
1	390-401 H: 1	391	SER	OG	C7	1	601	3.73	van der Waals
1	390-401 H: 1	391	SER	OG	O7	1	601	3.69	H.Bond
1	390-401 H: 1	391	SER	OG	O3A	1	601	3.5	H.Bond
1	390-401 H: 1	391	SER	OG	PB	1	601	3.25
1	390-401 H: 1	391	SER	OG	O2B	1	601	3.4	H.Bond
1	390-401 H: 1	391	SER	OG	O3B	1	601	2.47	H.Bond
1	390-401 H: 1	392	LEU	N	O2B	1	601	3.31	H.Bond
1	390-401 H: 1	392	LEU	CA	O2B	1	601	3.77	van der Waals
1	390-401 H: 1	392	LEU	CB	O2B	1	601	3.11	van der Waals
1	390-401 H: 1	392	LEU	CG	O2B	1	601	3.35	van der Waals
1	390-401 H: 1	392	LEU	CD1	O2B	1	601	3.88	van der Waals
1	No SSE	416	SER	O	N3*	1	601	3.95	H.Bond
1	No SSE	416	SER	O	C4*	1	601	3.92	van der Waals
1	No SSE	416	SER	O	N4*	1	601	3.04	H.Bond
1	417-419 H: 5	417	GLY	CA	N3*	1	601	3.47	H.Bond
1	417-419 H: 5	417	GLY	C	N3*	1	601	3.85	H.Bond
1	417-419 H: 5	418	ILE	N	C2*	1	601	3.88	H.Bond
1	417-419 H: 5	418	ILE	N	N3*	1	601	3.24	H.Bond
1	417-419 H: 5	418	ILE	N	C4*	1	601	3.93	H.Bond
1	417-419 H: 5	418	ILE	CG1	N1*	1	601	3.76	H.Bond
1	417-419 H: 5	418	ILE	CG1	C2*	1	601	3.51	van der Waals
1	417-419 H: 5	418	ILE	CG1	CM2	1	601	3.98	van der Waals
1	417-419 H: 5	418	ILE	CG1	N3*	1	601	3.61	H.Bond
1	417-419 H: 5	418	ILE	CG1	C4*	1	601	3.94	van der Waals
1	417-419 H: 5	418	ILE	CD1	CM4	1	601	3.91	van der Waals
1	417-419 H: 5	419	ASP	CB	CM2	1	601	3.6	van der Waals
1	417-419 H: 5	419	ASP	CG	CM2	1	601	3.65	van der Waals
1	417-419 H: 5	419	ASP	OD1	CM2	1	601	3.98	van der Waals
1	417-419 H: 5	419	ASP	OD2	CM2	1	601	3.94	van der Waals
1	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O2A	1	601	3.67	van der Waals
1	436-441 S: 1	441	GLY	CA	O3A	1	601	3.83	van der Waals
1	436-441 S: 1	441	GLY	C	O1A	1	601	3.87	van der Waals
1	436-441 S: 1	441	GLY	C	O2A	1	601	3.89	van der Waals
1	442-448 H: 1	442	ASP	N	O1A	1	601	3.18	H.Bond
1	442-448 H: 1	442	ASP	CA	O1A	1	601	3.96	van der Waals
1	442-448 H: 1	442	ASP	C	O1A	1	601	3.96	van der Waals
1	442-448 H: 1	442	ASP	CG	O1A	1	601	3.75	van der Waals
1	442-448 H: 1	442	ASP	OD1	O1A	1	601	3.61	H.Bond
1	442-448 H: 1	442	ASP	OD2	O1A	1	601	3.93	H.Bond
1	442-448 H: 1	443	LEU	N	PA	1	601	3.97
1	442-448 H: 1	443	LEU	N	O1A	1	601	3.05	H.Bond
1	442-448 H: 1	443	LEU	N	O2A	1	601	3.87	H.Bond
1	442-448 H: 1	443	LEU	CA	O1A	1	601	3.86	van der Waals
1	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O1A	1	601	3.65	van der Waals
1	442-448 H: 1	443	LEU	CB	O2A	1	601	3.98	van der Waals
1	442-448 H: 1	443	LEU	CG	O1A	1	601	3.87	van der Waals
1	442-448 H: 1	444	SER	N	O2A	1	601	3.18	H.Bond
1	442-448 H: 1	444	SER	CA	O2A	1	601	3.95	van der Waals
1	442-448 H: 1	444	SER	CB	O2A	1	601	3.6	van der Waals
1	442-448 H: 1	444	SER	OG	PA	1	601	3.88
1	442-448 H: 1	444	SER	OG	O2A	1	601	2.4	H.Bond
1	442-448 H: 1	447	TYR	CE2	CM2	1	601	3.77	van der Waals
1	442-448 H: 1	447	TYR	OH	CM2	1	601	3.87	van der Waals
1	No SSE	469	ASN	CG	O1B	1	601	3.19	van der Waals
1	No SSE	469	ASN	OD1	O1B	1	601	2.83	H.Bond
1	No SSE	469	ASN	ND2	PB	1	601	3.87
1	No SSE	469	ASN	ND2	O1B	1	601	2.81	H.Bond
1	No SSE	469	ASN	ND2	O2B	1	601	3.72	H.Bond
1	No SSE	471	GLY	C	O1A	1	601	3.72	van der Waals
1	No SSE	471	GLY	C	O1B	1	601	3.59	van der Waals
1	No SSE	471	GLY	O	O1A	1	601	3.06	H.Bond
1	No SSE	471	GLY	O	PB	1	601	3.89
1	No SSE	471	GLY	O	O1B	1	601	2.58	H.Bond
1	No SSE	472	GLY	N	O7	1	601	3.86	H.Bond
1	No SSE	472	GLY	N	O1B	1	601	3.92	H.Bond
1	No SSE	472	GLY	CA	C6	1	601	3.64	van der Waals
1	No SSE	472	GLY	CA	C7	1	601	3.83	van der Waals
1	No SSE	472	GLY	CA	O7	1	601	2.98	van der Waals
1	No SSE	472	GLY	CA	O1A	1	601	3.96	van der Waals
1	No SSE	472	GLY	CA	PB	1	601	3.74
1	No SSE	472	GLY	CA	O1B	1	601	3.35	van der Waals
1	No SSE	472	GLY	CA	O3B	1	601	3.07	van der Waals
1	No SSE	472	GLY	C	PB	1	601	3.94
1	No SSE	472	GLY	C	O1B	1	601	3.57	van der Waals
1	No SSE	472	GLY	C	O3B	1	601	3.12	van der Waals
1	No SSE	472	GLY	O	O3B	1	601	3.75	H.Bond
1	473-478 H: 1	473	GLN	N	PB	1	601	3.65
1	473-478 H: 1	473	GLN	N	O1B	1	601	2.99	H.Bond
1	473-478 H: 1	473	GLN	N	O3B	1	601	3.23	H.Bond
1	473-478 H: 1	474	ILE	N	O3B	1	601	3.29	H.Bond
1	473-478 H: 1	474	ILE	CB	O3B	1	601	3.86	van der Waals
1	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	S1	1	601	3.71	van der Waals
1	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	C6	1	601	3.82	van der Waals
1	473-478 H: 1	474	ILE	CG2	O3B	1	601	3.7	van der Waals
1	473-478 H: 1	475	PHE	CE2	C5	1	601	3.67	van der Waals
1	473-478 H: 1	475	PHE	CE2	C4	1	601	3.76	van der Waals
1	473-478 H: 1	475	PHE	CE2	CM4	1	601	3.77	van der Waals
1	473-478 H: 1	475	PHE	CE2	C6	1	601	3.64	van der Waals
1	473-478 H: 1	475	PHE	CZ	N3	1	601	3.94	H.Bond
1	473-478 H: 1	475	PHE	CZ	C5	1	601	3.73	van der Waals
1	473-478 H: 1	475	PHE	CZ	C4	1	601	3.59	van der Waals
1	473-478 H: 1	475	PHE	CZ	CM4	1	601	3.89	van der Waals
1	Water	743	HOH	O	PB	1	601	3.64
1	Water	743	HOH	O	O1B	1	601	3.88	H.Bond
1	Water	743	HOH	O	O2B	1	601	2.53	H.Bond

Nbr of Motifs
per PDB entry

PDB Entry

Title

Determination Method

Resolution

R-Factor

5A65

Crystal structure of mouse thiamine triphosphatase in complex with thiamine diphosphate, orthophosphate and magnesium ions

X-RAY

1.98

0.210

Motif No./Chain

Motif

Bound Ligand
/(Nbr. in PDB)

Show Details

1 / A

> Structure: SSLSSSH +12w
> Sequence: EKYDWRRKYAKM

TPP
/(1000)

[+]

> Graphics rep1:

[+]

> Graphics rep2:

[+]

Protein Chain	Prot SSE	Res Nbr	Res Name	RsAt.Name	LgAt.Name	Lg Chain	Lg Nbr	Bnd Len	Bnd Type
A	6-12 S: 0	9	GLU	OE2	O2A	A	1000	3.95	H.Bond
A	6-12 S: 0	11	LYS	CE	O1A	A	1000	3.86	van der Waals
A	6-12 S: 0	11	LYS	CE	O2A	A	1000	3.5	van der Waals
A	6-12 S: 0	11	LYS	NZ	PA	A	1000	3.82
A	6-12 S: 0	11	LYS	NZ	O2A	A	1000	2.69	H.Bond
A	28-41 S: -1	39	TYR	OH	C6	A	1000	3.94	van der Waals
A	28-41 S: -1	39	TYR	OH	C7	A	1000	3.35	van der Waals
A	No SSE	51	ASP	OD1	N4*	A	1000	3.73	H.Bond
A	53-57 S: -1	53	TRP	CG	C5	A	1000	3.97	van der Waals
A	53-57 S: -1	53	TRP	CG	C4	A	1000	3.93	van der Waals
A	53-57 S: -1	53	TRP	CG	CM4	A	1000	3.97	van der Waals
A	53-57 S: -1	53	TRP	CD1	C4	A	1000	3.91	van der Waals
A	53-57 S: -1	53	TRP	CD1	CM4	A	1000	3.62	van der Waals
A	53-57 S: -1	53	TRP	CD2	C5	A	1000	3.76	van der Waals
A	53-57 S: -1	53	TRP	CD2	C4	A	1000	3.83	van der Waals
A	53-57 S: -1	53	TRP	NE1	C7*	A	1000	3.94	H.Bond
A	53-57 S: -1	53	TRP	NE1	N3	A	1000	3.87	H.Bond
A	53-57 S: -1	53	TRP	NE1	C4	A	1000	3.79	H.Bond
A	53-57 S: -1	53	TRP	NE1	CM4	A	1000	3.79	H.Bond
A	53-57 S: -1	53	TRP	CE2	N3	A	1000	3.64	H.Bond
A	53-57 S: -1	53	TRP	CE2	C2	A	1000	3.93	van der Waals
A	53-57 S: -1	53	TRP	CE2	C4	A	1000	3.74	van der Waals
A	53-57 S: -1	53	TRP	CE3	S1	A	1000	3.85	van der Waals
A	53-57 S: -1	53	TRP	CE3	C5	A	1000	3.96	van der Waals
A	53-57 S: -1	53	TRP	CZ2	N4*	A	1000	3.5	H.Bond
A	53-57 S: -1	53	TRP	CZ2	C7*	A	1000	3.96	van der Waals
A	53-57 S: -1	53	TRP	CZ2	N3	A	1000	3.74	H.Bond
A	53-57 S: -1	53	TRP	CZ2	C2	A	1000	3.7	van der Waals
A	53-57 S: -1	53	TRP	CZ3	S1	A	1000	3.84	van der Waals
A	53-57 S: -1	53	TRP	CH2	C2	A	1000	3.77	van der Waals
A	53-57 S: -1	55	ARG	CZ	O3B	A	1000	3.87	van der Waals
A	53-57 S: -1	55	ARG	NH1	O3A	A	1000	3.37	H.Bond
A	53-57 S: -1	55	ARG	NH1	PB	A	1000	3.82
A	53-57 S: -1	55	ARG	NH1	O1B	A	1000	3.94	H.Bond
A	53-57 S: -1	55	ARG	NH1	O3B	A	1000	3.31	H.Bond
A	53-57 S: -1	55	ARG	NH2	O3B	A	1000	3.59	H.Bond
A	53-57 S: -1	57	ARG	CZ	O3B	A	1000	3.84	van der Waals
A	53-57 S: -1	57	ARG	NH1	O3B	A	1000	3.84	H.Bond
A	53-57 S: -1	57	ARG	NH2	PB	A	1000	3.71
A	53-57 S: -1	57	ARG	NH2	O1B	A	1000	3.22	H.Bond
A	53-57 S: -1	57	ARG	NH2	O3B	A	1000	3.02	H.Bond
A	61-67 S: -1	65	LYS	NZ	O7	A	1000	3.91	H.Bond
A	61-67 S: -1	65	LYS	NZ	O3A	A	1000	3.9	H.Bond
A	79-82 S: -1	79	TYR	CZ	C7*	A	1000	3.96	van der Waals
A	79-82 S: -1	79	TYR	CZ	CM4	A	1000	3.86	van der Waals
A	79-82 S: -1	79	TYR	OH	C5*	A	1000	3.96	van der Waals
A	79-82 S: -1	79	TYR	OH	C7*	A	1000	3.12	van der Waals
A	192-202 H: 1	192	ALA	CB	S1	A	1000	3.98	van der Waals
A	192-202 H: 1	192	ALA	CB	O1A	A	1000	3.5	van der Waals
A	192-202 H: 1	193	LYS	CE	O1B	A	1000	3.67	van der Waals
A	192-202 H: 1	193	LYS	NZ	PB	A	1000	3.89
A	192-202 H: 1	193	LYS	NZ	O1B	A	1000	2.88	H.Bond
A	192-202 H: 1	193	LYS	NZ	O2B	A	1000	3.74	H.Bond
A	192-202 H: 1	195	MET	CG	C2	A	1000	3.82	van der Waals
A	192-202 H: 1	195	MET	SD	C2	A	1000	3.94	van der Waals
A	Water	2006	HOH	O	O2A	A	1000	3.52	H.Bond
A	Water	2006	HOH	O	O3A	A	1000	3.83	H.Bond
A	Water	2006	HOH	O	PB	A	1000	3.51
A	Water	2006	HOH	O	O2B	A	1000	2.69	H.Bond
A	Water	2006	HOH	O	O3B	A	1000	3.56	H.Bond
A	Water	2008	HOH	O	O2A	A	1000	3.54	H.Bond
A	Water	2027	HOH	O	PB	A	1000	3.99
A	Water	2027	HOH	O	O1B	A	1000	2.74	H.Bond
A	Water	2035	HOH	O	C2*	A	1000	3.78	van der Waals
A	Water	2035	HOH	O	CM2	A	1000	2.98	van der Waals
A	Water	2036	HOH	O	O3A	A	1000	3.39	H.Bond
A	Water	2036	HOH	O	PB	A	1000	3.59
A	Water	2036	HOH	O	O3B	A	1000	2.62	H.Bond
A	Water	2047	HOH	O	O2B	A	1000	3.79	H.Bond
A	Water	2052	HOH	O	O2B	A	1000	2.83	H.Bond
A	Water	2064	HOH	O	N1*	A	1000	3.94	H.Bond
A	Water	2065	HOH	O	N1*	A	1000	2.85	H.Bond
A	Water	2065	HOH	O	C2*	A	1000	3.52	van der Waals
A	Water	2065	HOH	O	CM2	A	1000	3.69	van der Waals
A	Water	2065	HOH	O	C6*	A	1000	3.54	van der Waals
A	Water	2066	HOH	O	O1A	A	1000	2.77	H.Bond
A	Water	2066	HOH	O	O2B	A	1000	3.82	H.Bond
A	Water	2067	HOH	O	C7	A	1000	3.38	van der Waals
A	Water	2067	HOH	O	PA	A	1000	3.8
A	Water	2067	HOH	O	O1A	A	1000	2.65	H.Bond
A	Water	2067	HOH	O	O1B	A	1000	3.92	H.Bond
A	Water	2073	HOH	O	C6*	A	1000	3.72	van der Waals
A	Water	2073	HOH	O	C7*	A	1000	3.9	van der Waals
A	Water	2073	HOH	O	N3	A	1000	3.32	H.Bond
A	Water	2073	HOH	O	C2	A	1000	3.68	van der Waals
A	Water	2073	HOH	O	S1	A	1000	3.97
A	Water	2073	HOH	O	C5	A	1000	3.45	van der Waals
A	Water	2073	HOH	O	C4	A	1000	3.15	van der Waals
A	Water	2073	HOH	O	CM4	A	1000	3.61	van der Waals
A	Water	2073	HOH	O	C7	A	1000	3.99	van der Waals
A	Water	2073	HOH	O	O7	A	1000	3.3	H.Bond
A	Water	2073	HOH	O	PA	A	1000	3.68
A	Water	2073	HOH	O	O2A	A	1000	3.07	H.Bond